More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2103 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  48.3 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  43.59 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  47.78 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  48.43 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2409  ABC transporter related  45.45 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  44.02 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  43.48 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.994247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0077  ABC transporter related  44.1 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0734436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  40.1 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  38.46 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  40.85 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7996  ABC transporter related  40.85 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0883006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  30.16 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  30.16 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  36.04 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  30.37 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  36.27 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0283  ABC transporter related  31.28 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3964  ABC transporter related  34.91 
 
 		 255 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.34 
 
 		 536 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  32.83 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  29.19 
 
 		 240 aa  92.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  30.5 
 
 		 543 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  32.31 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  29.69 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  29.5 
 
 		 543 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  35.05 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  34.36 
 
 		 349 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  34.36 
 
 		 349 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  34.36 
 
 		 349 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0162  ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  32 
 
 		 527 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  31.31 
 
 		 352 aa  89.4  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  30.35 
 
 		 366 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  34.9 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  31.16 
 
 		 396 aa  89  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  31.67 
 
 		 351 aa  89  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  32.62 
 
 		 364 aa  88.6  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 379 aa  88.6  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  33.51 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  35.11 
 
 		 230 aa  88.2  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  29.21 
 
 		 312 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.25 
 
 		 370 aa  88.2  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0186  ABC transporter related  34.62 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.475038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  30.77 
 
 		 258 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  30.66 
 
 		 565 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3104  ABC transporter related  30.69 
 
 		 574 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00494519  hitchhiker  0.000204056 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  30 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  29.21 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  30.73 
 
 		 369 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  27.75 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  31.07 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4672  ABC transporter, ATP-binding protein  31.07 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  31.07 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  32.16 
 
 		 524 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  33.33 
 
 		 384 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  35.16 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.16 
 
 		 365 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  29.8 
 
 		 326 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  35.45 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  34.52 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  30.81 
 
 		 246 aa  86.3  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  33.68 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4810  ABC transporter ATP-binding protein  31.07 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0688  ABC transporter related  26.21 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.873107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5175  ABC transporter ATP-binding protein  31.07 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1770  ABC transporter related  26.21 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.529989  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  33.68 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 		 343 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  37.16 
 
 		 343 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  31.02 
 
 		 543 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  29.9 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  33.68 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 		 343 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3794  ABC transporter related  30.39 
 
 		 377 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5140  ABC transporter related  32.03 
 
 		 588 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187142  normal  0.0538978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  32.99 
 
 		 274 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5083  ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  30.05 
 
 		 244 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  33.15 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  30.95 
 
 		 544 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.82 
 
 		 534 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  33.86 
 
 		 242 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.66 
 
 		 525 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  32.97 
 
 		 259 aa  84.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5642  ABC transporter related protein  34.52 
 
 		 230 aa  84.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  30.93 
 
 		 357 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  37.5 
 
 		 236 aa  84.7  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 		 369 aa  84.7  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  33.01 
 
 		 550 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  30.89 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  29.69 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  30.85 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  30.05 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  35.9 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  30 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>