More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2240 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7996  ABC transporter related  99.03 
 
 		 206 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0883006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  74.37 
 
 		 223 aa  276  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  49.73 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  46.52 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  49.44 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2409  ABC transporter related  45.5 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  46.45 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  49.71 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  42.78 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0077  ABC transporter related  43.4 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0734436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  43.08 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  39.18 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.994247 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  37.16 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  29.76 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 276 aa  95.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  36.31 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 253 aa  92  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  34.55 
 
 		 722 aa  92  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2196  cell division ATP-binding protein FtsE  33.51 
 
 		 228 aa  91.3  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000206385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  36.04 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  35.38 
 
 		 260 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  29.32 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  34.83 
 
 		 228 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  29.32 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  34.52 
 
 		 256 aa  89.4  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (proline/glycine/betaine)  34.54 
 
 		 367 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5942  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  36.46 
 
 		 552 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  36.55 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  34.43 
 
 		 232 aa  88.2  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07870  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  34.67 
 
 		 223 aa  87.8  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.995675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  35.9 
 
 		 267 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  35.64 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 		 592 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  34.43 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.33 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1545  cell division ATP-binding protein FtsE  39.31 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.76 
 
 		 240 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  87  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.68 
 
 		 364 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  33.16 
 
 		 604 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.64 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  32.56 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.67 
 
 		 274 aa  86.3  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  34.41 
 
 		 716 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3494  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  31.05 
 
 		 621 aa  86.3  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  36.04 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0352  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33 
 
 		 553 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  31.49 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  34.17 
 
 		 360 aa  85.9  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1406  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  34.05 
 
 		 376 aa  85.5  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  35.8 
 
 		 277 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  29.59 
 
 		 371 aa  85.1  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  32.98 
 
 		 722 aa  85.5  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  38.67 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 250 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  38.92 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  38.92 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 270 aa  84.7  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.5 
 
 		 574 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  32.14 
 
 		 251 aa  84.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  34.59 
 
 		 362 aa  84.7  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  36.08 
 
 		 408 aa  84.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4886  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  28.44 
 
 		 382 aa  84.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  0.719773 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  29.84 
 
 		 246 aa  84.7  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  32.04 
 
 		 244 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.5 
 
 		 574 aa  84.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  35.52 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  30.98 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  29.95 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  32.31 
 
 		 616 aa  84  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  31.61 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  33.17 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.18 
 
 		 603 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  37.19 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  36.22 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1951  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.98 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26260  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  33.33 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.560056  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  36.78 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2245  ABC transporter related  31.82 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  32.98 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  32.2 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.52 
 
 		 590 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  30.21 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  33.16 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3636  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.90014  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  37.93 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  36.14 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  35.68 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>