More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3104 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3104  ABC transporter related  100 
 
 		 574 aa  1161    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00494519  hitchhiker  0.000204056 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.63 
 
 		 602 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  27.16 
 
 		 617 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  26.46 
 
 		 612 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  26.46 
 
 		 612 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  27.08 
 
 		 631 aa  194  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  27.08 
 
 		 596 aa  194  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  27.08 
 
 		 596 aa  194  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  27.51 
 
 		 591 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  27.06 
 
 		 590 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  27.09 
 
 		 622 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 		 577 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  27.59 
 
 		 646 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  26.02 
 
 		 597 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  25.75 
 
 		 610 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3300  ABC transporter related  27.19 
 
 		 609 aa  187  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0999456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  26.44 
 
 		 598 aa  187  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  26.22 
 
 		 661 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  27.42 
 
 		 598 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  27.42 
 
 		 598 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0865  putative ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  26.21 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  26.02 
 
 		 607 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  27 
 
 		 596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  26.39 
 
 		 590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  27.34 
 
 		 598 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  27.34 
 
 		 598 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  26.47 
 
 		 598 aa  184  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0659  ABC transporter, ATP-binding protein  28.18 
 
 		 594 aa  183  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000175742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  27.11 
 
 		 640 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  26.32 
 
 		 605 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  26.37 
 
 		 591 aa  183  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  26.64 
 
 		 594 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3046  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  27.47 
 
 		 988 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3174  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  27.47 
 
 		 988 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  25.77 
 
 		 607 aa  182  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5655  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 935 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  26.6 
 
 		 596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1304  putative ABC transporter, ATP-binding protein  27.47 
 
 		 988 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1994  putative ABC transporter, ATP-binding protein  27.47 
 
 		 965 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.310969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1392  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  27.47 
 
 		 988 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.659485  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  26.19 
 
 		 593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1016  putative ABC transporter, ATP-binding protein  27.47 
 
 		 988 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  26.49 
 
 		 623 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  25.18 
 
 		 603 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  24.77 
 
 		 629 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  26.27 
 
 		 652 aa  180  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  26.49 
 
 		 623 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2280  putative ABC transporter, ATP-binding protein  27.29 
 
 		 988 aa  180  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  26.14 
 
 		 621 aa  180  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  26.07 
 
 		 590 aa  180  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  25.04 
 
 		 655 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  25.18 
 
 		 595 aa  179  9e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1388  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 921 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  26.22 
 
 		 597 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6441  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 933 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  26.49 
 
 		 623 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  26.49 
 
 		 623 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6032  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 933 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340327  normal  0.371985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  26.49 
 
 		 623 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2616  ABC transporter ATP-binding protein  27.16 
 
 		 591 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  27.45 
 
 		 624 aa  178  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6403  response regulator receiver protein  24.61 
 
 		 936 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.452757  normal  0.164839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  26.16 
 
 		 606 aa  178  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  25.88 
 
 		 608 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  26.09 
 
 		 592 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  27.11 
 
 		 663 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  27.11 
 
 		 662 aa  177  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  26.32 
 
 		 623 aa  177  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  26.06 
 
 		 623 aa  177  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  24.02 
 
 		 654 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  25.84 
 
 		 615 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.22 
 
 		 651 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  25.31 
 
 		 612 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  25.38 
 
 		 672 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  27.36 
 
 		 608 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  26.65 
 
 		 655 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  24.68 
 
 		 630 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.32 
 
 		 623 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.32 
 
 		 623 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.32 
 
 		 623 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  26.5 
 
 		 654 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.32 
 
 		 623 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.32 
 
 		 623 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.32 
 
 		 623 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  27.33 
 
 		 644 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5437  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 914 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.04493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  30.12 
 
 		 672 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  27.11 
 
 		 647 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  28.18 
 
 		 651 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  27.46 
 
 		 621 aa  172  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  26.36 
 
 		 619 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  26 
 
 		 589 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5251  response regulator receiver protein  27.85 
 
 		 893 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0456799 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  25.94 
 
 		 603 aa  171  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  25.94 
 
 		 603 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  24.61 
 
 		 612 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  26.32 
 
 		 656 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  26.5 
 
 		 629 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.06 
 
 		 628 aa  168  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  26.55 
 
 		 607 aa  169  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>