More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0197 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  100 
 
 		 206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.994247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  55.33 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  50.78 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  45.41 
 
 		 202 aa  167  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  50 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0077  ABC transporter related  48.17 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0734436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  43.09 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  45.41 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  44.61 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  45.11 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2409  ABC transporter related  44.5 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  48.22 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  42.27 
 
 		 197 aa  137  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  43.32 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7996  ABC transporter related  43.85 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0883006  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  31.96 
 
 		 220 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  31.96 
 
 		 220 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.07 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  36.07 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  36.07 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.14 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.11 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  36.11 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.11 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.11 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.11 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.11 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  40.69 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  39.02 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.82 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 276 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.82 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.82 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.82 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 231 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 231 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 231 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 231 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 231 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.33 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  38.69 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  39.41 
 
 		 266 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  37.06 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.06 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4672  ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  32.98 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  31.94 
 
 		 244 aa  99  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  34.29 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  38.14 
 
 		 358 aa  97.8  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  39.41 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  35.47 
 
 		 347 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  37.1 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  34.22 
 
 		 264 aa  96.7  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4810  ABC transporter ATP-binding protein  33.68 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5175  ABC transporter ATP-binding protein  33.68 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  33.5 
 
 		 327 aa  96.3  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  37.63 
 
 		 358 aa  96.3  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  29.08 
 
 		 240 aa  95.1  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  33.78 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1081  ABC transporter related protein  33.5 
 
 		 323 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.136277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  35.53 
 
 		 386 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5083  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  36.99 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  36.73 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  35.82 
 
 		 370 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  29.68 
 
 		 250 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  37.07 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0573  ABC transporter related protein  28.79 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  32.46 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 387 aa  92.8  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  35.82 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1444  ATPase  35.32 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  31.31 
 
 		 303 aa  92.8  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  36.54 
 
 		 233 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  34.62 
 
 		 360 aa  92.8  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  38.95 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 354 aa  92.8  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  35.85 
 
 		 233 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  35.85 
 
 		 233 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  31.66 
 
 		 322 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  32.7 
 
 		 266 aa  91.7  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 364 aa  91.3  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  31.37 
 
 		 227 aa  91.3  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  35.71 
 
 		 224 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  35.47 
 
 		 225 aa  91.3  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.17 
 
 		 376 aa  90.5  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.43 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1187  ABC transporter related  29.21 
 
 		 241 aa  90.5  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6287  ABC transporter related  35.55 
 
 		 349 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  30.09 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1347  ABC transporter-related protein  33.49 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.652945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 372 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>