More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0701 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  51.67 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  48.55 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  50.54 
 
 		 225 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  46.19 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  49.72 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2409  ABC transporter related  45.03 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  41.58 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7996  ABC transporter related  49.13 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0883006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  45.61 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0077  ABC transporter related  42.93 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0734436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  46.7 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  38.46 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.23 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 206 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.994247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  33.5 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  33.5 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.5 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.5 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.5 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.5 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  33.5 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.5 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.99 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.67 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.67 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.67 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.67 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.17 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  34.76 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 		 216 aa  104  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  34.76 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.68 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  31.11 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  31.75 
 
 		 252 aa  99.4  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  31.75 
 
 		 252 aa  99.4  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.09 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.1 
 
 		 276 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2129  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.29 
 
 		 240 aa  98.2  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5023  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 295 aa  98.2  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  38.07 
 
 		 251 aa  97.8  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  28.51 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 231 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  36.41 
 
 		 252 aa  96.3  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 264 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 276 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0315  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  30.21 
 
 		 284 aa  96.3  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.5 
 
 		 373 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  35.32 
 
 		 375 aa  95.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  33.17 
 
 		 259 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3104  ABC transporter related  31.63 
 
 		 574 aa  93.2  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00494519  hitchhiker  0.000204056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.85 
 
 		 388 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  34.44 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  34.83 
 
 		 359 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2276  ABC transporter related  34.8 
 
 		 249 aa  92.8  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  36.32 
 
 		 635 aa  92.8  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  33.17 
 
 		 326 aa  92.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5083  ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0360  molybdenum transport ATP-binding protein  31.44 
 
 		 283 aa  92.8  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  31.87 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  32.16 
 
 		 312 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  34.34 
 
 		 244 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  37.31 
 
 		 345 aa  92  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2255  phosphate transporter ATP-binding protein  32.54 
 
 		 263 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  35.5 
 
 		 351 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.41 
 
 		 372 aa  92  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1532  phosphate transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 		 263 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  34.33 
 
 		 350 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4915  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.92 
 
 		 260 aa  91.7  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  normal  0.341234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3956  ABC transporter related  35.2 
 
 		 355 aa  91.7  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.396032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.66 
 
 		 359 aa  91.3  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.33 
 
 		 378 aa  91.3  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.01 
 
 		 345 aa  91.3  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2314  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.77 
 
 		 259 aa  91.3  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 312 aa  90.5  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 312 aa  90.5  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  37.25 
 
 		 613 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 312 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4769  ABC transporter related protein  33.65 
 
 		 299 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339354  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  38.38 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2376  ABC transporter related  33.82 
 
 		 249 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  37.11 
 
 		 257 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  38.38 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  31.66 
 
 		 308 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  31.66 
 
 		 308 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4888  ABC transporter related  35.53 
 
 		 310 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  hitchhiker  0.00773492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2629  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  31.4 
 
 		 260 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.10241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0983  ABC transporter, ATP-binding protein, MsbA family  34.02 
 
 		 562 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  32.24 
 
 		 722 aa  89.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  36.63 
 
 		 344 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1097  ABC transporter related  34.02 
 
 		 562 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.54 
 
 		 386 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.54 
 
 		 386 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  33 
 
 		 364 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>