More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1847 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  100 
 
 
369 aa  741    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  45.43 
 
 
376 aa  308  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  49.31 
 
 
355 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  47.32 
 
 
355 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  43.53 
 
 
354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.31 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.35 
 
 
367 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  42.7 
 
 
354 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  46.2 
 
 
372 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  43.45 
 
 
356 aa  264  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.13 
 
 
355 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.61 
 
 
383 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  39.34 
 
 
383 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.61 
 
 
383 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.78 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  38.29 
 
 
373 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  43.3 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.94 
 
 
383 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  39.62 
 
 
383 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  39.83 
 
 
367 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  39.61 
 
 
375 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  42 
 
 
354 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.83 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.01 
 
 
392 aa  242  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  41.58 
 
 
386 aa  242  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  38.66 
 
 
352 aa  242  9e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  41.58 
 
 
386 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  38.59 
 
 
377 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  41.8 
 
 
386 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.37 
 
 
354 aa  239  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.55 
 
 
350 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.95 
 
 
383 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.98 
 
 
374 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  40.06 
 
 
384 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  36.59 
 
 
370 aa  228  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  36.46 
 
 
369 aa  227  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  36.39 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.24 
 
 
377 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.47 
 
 
361 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  36.94 
 
 
386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.25 
 
 
368 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  36.69 
 
 
373 aa  219  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  39.43 
 
 
396 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  35.92 
 
 
379 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  36.16 
 
 
338 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  37.22 
 
 
381 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.11 
 
 
357 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  34.43 
 
 
354 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  34.72 
 
 
370 aa  216  5e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.98 
 
 
368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  35.81 
 
 
380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.93 
 
 
372 aa  209  6e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.53 
 
 
368 aa  209  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  35.21 
 
 
367 aa  209  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  40.39 
 
 
360 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.44 
 
 
380 aa  207  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.14 
 
 
343 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.02 
 
 
347 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.38 
 
 
366 aa  203  4e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.36 
 
 
353 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  36.11 
 
 
381 aa  196  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  36.31 
 
 
347 aa  195  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.26 
 
 
368 aa  195  9e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.8 
 
 
339 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.08 
 
 
379 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  35.8 
 
 
379 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  42.49 
 
 
453 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0860  RIP metalloprotease RseP  36.36 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.01 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  34.9 
 
 
348 aa  179  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.6 
 
 
451 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.57 
 
 
456 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.53 
 
 
377 aa  176  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  42.92 
 
 
450 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.63 
 
 
418 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.19 
 
 
449 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  40.87 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.13 
 
 
455 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  37.97 
 
 
454 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  33.15 
 
 
336 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.13 
 
 
455 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.73 
 
 
450 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  41.81 
 
 
454 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1972  hypothetical protein  41.13 
 
 
453 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.31127 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  30.48 
 
 
377 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  34.88 
 
 
341 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.13 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  30.98 
 
 
337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  36.78 
 
 
456 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  33.42 
 
 
349 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.93 
 
 
455 aa  166  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.05 
 
 
450 aa  166  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.06 
 
 
454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3629  peptidase M50  32.1 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  41.2 
 
 
466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.03 
 
 
455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  37.76 
 
 
456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  38.17 
 
 
456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  38.53 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>