64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1025 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  317  3e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  96.2 
 
 		 158 aa  305  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  90.57 
 
 		 159 aa  285  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  72.96 
 
 		 159 aa  231  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  55.56 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 173 aa  100  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  43.12 
 
 		 178 aa  99.8  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  29.05 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 177 aa  87.8  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  32.92 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 163 aa  84  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  29.83 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  23.73 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  28.22 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  27.2 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.35 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35190  DNA-binding protein  42 
 
 		 65 aa  44.3  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1572  transcriptional regulator, XRE family  21.51 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 325 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  35.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  35.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  31.58 
 
 		 182 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2656  transcription factor of MBF1-like protein  20.99 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 300 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 252 aa  41.6  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 371 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1157  DNA binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0872862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 205 aa  40.8  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 279 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 189 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>