50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35190 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_35190  DNA-binding protein  100 
 
 		 65 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1266  XRE family transcriptional regulator  60.34 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461097  normal  0.0226828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1308  XRE family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 112 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019995  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1716  Cro/CI family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000130124  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4003  XRE family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000134059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1317  XRE family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000865545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1596  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  54.84 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000735944  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3888  hypothetical protein  51.61 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000176936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1673  XRE family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189543  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1864  putative transcriptional regulator  64.44 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21850  putative transcriptional regulator  57.69 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000342125  hitchhiker  0.00251437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3072  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0716873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  44.68 
 
 		 503 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  44 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1778  transcriptional regulator, XRE family  48.94 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 474 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  48.78 
 
 		 49 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  44.68 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42 
 
 		 481 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 403 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 446 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 488 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 371 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 279 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 300 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 470 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  42.31 
 
 		 475 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 475 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>