More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3011 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
389 aa  783    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.93 
 
 
387 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  45.81 
 
 
384 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  44.62 
 
 
387 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  44.47 
 
 
397 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 
400 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 
401 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  43.37 
 
 
384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  46.21 
 
 
381 aa  286  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  42.52 
 
 
381 aa  282  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  42.45 
 
 
387 aa  282  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.41 
 
 
389 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.74 
 
 
391 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  44.06 
 
 
394 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  41.73 
 
 
385 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  40.96 
 
 
409 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  45.56 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.58 
 
 
392 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.94 
 
 
385 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  42.4 
 
 
385 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  42.31 
 
 
385 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  41.33 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  42.4 
 
 
385 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 
398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.94 
 
 
402 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.84 
 
 
405 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  40.69 
 
 
404 aa  265  8.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  40.69 
 
 
385 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  38.05 
 
 
392 aa  264  3e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 
393 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.05 
 
 
387 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  39.79 
 
 
385 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  43.72 
 
 
393 aa  257  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.86 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  39.37 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  38.17 
 
 
390 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  39.16 
 
 
386 aa  252  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  39.27 
 
 
386 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.32 
 
 
399 aa  252  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  38.8 
 
 
385 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  40.72 
 
 
382 aa  233  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  38.42 
 
 
385 aa  229  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  37.34 
 
 
407 aa  219  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0222  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 
371 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.89 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.8 
 
 
390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  37.24 
 
 
409 aa  216  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  36.64 
 
 
408 aa  215  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.88 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  36.46 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.2 
 
 
393 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 
412 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.68 
 
 
384 aa  212  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.53 
 
 
390 aa  212  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 
416 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  35.99 
 
 
408 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.76 
 
 
394 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.06 
 
 
382 aa  209  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.6 
 
 
387 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.53 
 
 
389 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2244  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.77 
 
 
384 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1745  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
405 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.76 
 
 
396 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.03 
 
 
374 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  35.43 
 
 
401 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  37.19 
 
 
384 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 
394 aa  206  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  36.39 
 
 
403 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.6 
 
 
383 aa  206  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  36.08 
 
 
417 aa  205  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.14 
 
 
419 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3079  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.62 
 
 
380 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.862444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  36.54 
 
 
395 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 
384 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  35.84 
 
 
391 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.12 
 
 
385 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  29.61 
 
 
375 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  35.28 
 
 
386 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  35.84 
 
 
404 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.15 
 
 
406 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5052  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.1 
 
 
404 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 
381 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2375  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.65 
 
 
374 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.950801  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1553  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.07 
 
 
423 aa  202  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  35.88 
 
 
383 aa  202  7e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0847  coproporphyrinogen III oxidase  35.88 
 
 
383 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.9 
 
 
403 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  34.92 
 
 
422 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.29 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0352  hypothetical protein  33.33 
 
 
375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  35.36 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2548  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.41 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  36.41 
 
 
409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.06 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  35.17 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  35.36 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2770  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.96 
 
 
391 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  36.05 
 
 
405 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 
404 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>