166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1926 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1926  tRNA 2-selenouridine synthase  100 
 
 		 353 aa  707    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3656  tRNA 2-selenouridine synthase  55.15 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167107 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3290  tRNA 2-selenouridine synthase  54.39 
 
 		 350 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3604  tRNA 2-selenouridine synthase  54.09 
 
 		 350 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3478  tRNA 2-selenouridine synthase  49.85 
 
 		 348 aa  318  7.999999999999999e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.527623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3349  tRNA 2-selenouridine synthase  51.33 
 
 		 353 aa  318  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2715  tRNA 2-selenouridine synthase  47.42 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2244  tRNA 2-selenouridine synthase  47.01 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.590434  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1545  tRNA 2-selenouridine synthase  46.22 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.256667  normal  0.0827797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2803  tRNA 2-selenouridine synthase  47.16 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3480  tRNA 2-selenouridine synthase  47.46 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0523  tRNA 2-selenouridine synthase  51.92 
 
 		 365 aa  292  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3666  tRNA 2-selenouridine synthase  44.18 
 
 		 356 aa  292  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1757  tRNA 2-selenouridine synthase  47.1 
 
 		 346 aa  288  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3859  tRNA 2-selenouridine synthase  44.88 
 
 		 353 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1349  tRNA 2-selenouridine synthase  49.02 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3032  tRNA 2-selenouridine synthase  43.43 
 
 		 352 aa  285  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000366048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1112  tRNA 2-selenouridine synthase  46.89 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1592  tRNA 2-selenouridine synthase  46.89 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0414382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1569  tRNA 2-selenouridine synthase  46.56 
 
 		 375 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1508  tRNA 2-selenouridine synthase  44.65 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2556  tRNA 2-selenouridine synthase  45.78 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1488  tRNA 2-selenouridine synthase  44.34 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4730  tRNA 2-selenouridine synthase  45.9 
 
 		 375 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.913097  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1645  tRNA 2-selenouridine synthase  45.34 
 
 		 377 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1887  tRNA 2-selenouridine synthase  44.86 
 
 		 352 aa  275  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227051  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6564  tRNA 2-selenouridine synthase  44.44 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0745888  hitchhiker  0.00486619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0932  tRNA 2-selenouridine synthase  45.42 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0765  tRNA 2-selenouridine synthase  45.42 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0620  tRNA 2-selenouridine synthase  45.42 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0754  tRNA 2-selenouridine synthase  45.1 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1022  tRNA 2-selenouridine synthase  41.37 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.239082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3699  tRNA 2-selenouridine synthase  44.81 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.919346 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0816  rhodanese domain-containing protein  41.04 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.400282  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2084  tRNA 2-selenouridine synthase  43.4 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2423  tRNA 2-selenouridine synthase  42.69 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_10242  predicted protein  42.37 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.85356  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2199  2-selenouridine synthase  41.99 
 
 		 281 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5476  tRNA 2-selenouridine synthase  35.92 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2691  tRNA 2-selenouridine synthase  38.06 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.7307300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2384  tRNA 2-selenouridine synthase  37.09 
 
 		 345 aa  205  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.55321e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1525  tRNA 2-selenouridine synthase  37.42 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0672649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4991  tRNA 2-selenouridine synthase  38.2 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0663375  normal  0.0359024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1190  tRNA 2-selenouridine synthase  36.91 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000287258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0278  tRNA 2-selenouridine synthase  38.44 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4284  rhodanese-like protein  37.58 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1933  tRNA 2-selenouridine synthase  36.83 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3301  tRNA 2-selenouridine synthase  35.81 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0948  tRNA 2-selenouridine synthase  37.87 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3130  tRNA 2-selenouridine synthase  35.91 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000658834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3539  tRNA 2-selenouridine synthase  35.37 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07681  tRNA 2-selenouridine synthase  33.64 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104212  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2386  tRNA 2-selenouridine synthase  40.74 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0136  tRNA 2-selenouridine synthase  33.77 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303131  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07211  tRNA 2-selenouridine synthase  34.68 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1198  tRNA 2-selenouridine synthase  38.14 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09351  tRNA 2-selenouridine synthase  35.41 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09341  tRNA 2-selenouridine synthase  35.36 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2383  tRNA 2-selenouridine synthase  35.37 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3113  tRNA 2-selenouridine synthase  34.54 
 
 		 354 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2327  tRNA 2-selenouridine synthase  31.68 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2041  tRNA 2-selenouridine synthase  31.68 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1272  tRNA 2-selenouridine synthase  36.72 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0043  tRNA 2-selenouridine synthase  31.38 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16371  tRNA 2-selenouridine synthase  39.08 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.218284 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1304  tRNA 2-selenouridine synthase  32.34 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0608  tRNA 2-selenouridine synthase  31.8 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1955  tRNA 2-selenouridine synthase  30.82 
 
 		 336 aa  167  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.190021  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0875  tRNA 2-selenouridine synthase  34.21 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1887  tRNA 2-selenouridine synthase  38.02 
 
 		 344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.739187 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0521  tRNA 2-selenouridine synthase  30.82 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1434  tRNA 2-selenouridine synthase  30.49 
 
 		 332 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10081  tRNA 2-selenouridine synthase  31.13 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.741819  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0142  tRNA 2-selenouridine synthase  29.87 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0928  tRNA 2-selenouridine synthase  28.62 
 
 		 327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14782  predicted protein  37.92 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.597893 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0227  tRNA 2-selenouridine synthase  30.89 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.254912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0512  tRNA 2-selenouridine synthase  36.36 
 
 		 361 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0985  tRNA 2-selenouridine synthase  26.73 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0285  tRNA 2-selenouridine synthase  32.4 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4342  tRNA 2-selenouridine synthase  29.62 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  hitchhiker  0.00245617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1023  tRNA 2-selenouridine synthase  29.13 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0134  tRNA 2-selenouridine synthase  29.72 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3619  tRNA 2-selenouridine synthase  30.56 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2719  tRNA 2-selenouridine synthase  32.3 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0160  tRNA 2-selenouridine synthase  31.97 
 
 		 365 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.334237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3544  tRNA 2-selenouridine synthase  34.02 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0301  tRNA 2-selenouridine synthase  35.48 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0176  tRNA 2-selenouridine synthase  35.84 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2396  tRNA 2-selenouridine synthase  28.53 
 
 		 370 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0189  tRNA 2-selenouridine synthase  30.51 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0697371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0172  tRNA 2-selenouridine synthase  35.24 
 
 		 368 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0769  tRNA 2-selenouridine synthase  32.23 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.649423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0195  tRNA 2-selenouridine synthase  34.08 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0119  tRNA 2-selenouridine synthase  30.14 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4714  tRNA 2-selenouridine synthase  32.51 
 
 		 368 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4183  tRNA 2-selenouridine synthase  34.96 
 
 		 368 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4081  tRNA 2-selenouridine synthase  35.24 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0174  tRNA 2-selenouridine synthase  34.53 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0169  tRNA 2-selenouridine synthase  34.53 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0272703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>