More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0646 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  723    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  66.47 
 
 		 334 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  62.68 
 
 		 351 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  60.85 
 
 		 355 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  60.8 
 
 		 359 aa  435  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  60.8 
 
 		 377 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  59.32 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 360 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  57.95 
 
 		 359 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  59.66 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  57.02 
 
 		 359 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  60.17 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  57.88 
 
 		 351 aa  414  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  58 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  56.46 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  58.4 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  55.18 
 
 		 363 aa  401  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  57.91 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 361 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  59.83 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  57.76 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  54.94 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  53.24 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  57.8 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  53.24 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  53.33 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  53.62 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 363 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0406  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  51.59 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0512  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>