More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0293 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  100 
 
 
449 aa  882    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  62.81 
 
 
447 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  53.58 
 
 
437 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  56.12 
 
 
435 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  56.87 
 
 
440 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  54.19 
 
 
414 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  52.24 
 
 
416 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  51 
 
 
416 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  51 
 
 
416 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  51.46 
 
 
416 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  51.34 
 
 
416 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  51 
 
 
416 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  52.08 
 
 
416 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  51.24 
 
 
416 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  50.49 
 
 
408 aa  363  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  50 
 
 
416 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  50 
 
 
416 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  49.63 
 
 
416 aa  359  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  53.69 
 
 
409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  50.61 
 
 
416 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  51.69 
 
 
426 aa  354  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  51.7 
 
 
417 aa  352  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  50 
 
 
409 aa  350  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  51.12 
 
 
416 aa  350  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  51.09 
 
 
421 aa  348  8e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  55.2 
 
 
414 aa  345  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  53.68 
 
 
414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  50.61 
 
 
416 aa  343  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  50.37 
 
 
420 aa  342  7e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  53.93 
 
 
381 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0196  putative ammonium transporter, marine subtype  54.46 
 
 
417 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  52.84 
 
 
406 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2904  Rh-like protein/ammonium transporter  50.49 
 
 
416 aa  332  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0136  putative ammonium transporter  53 
 
 
411 aa  329  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000107717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1340  ammonium transporter  50.52 
 
 
417 aa  326  7e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  49.15 
 
 
416 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0492  Rh-like protein/ammonium transporter  51.19 
 
 
422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0233  ammonium transporter  49.88 
 
 
411 aa  319  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0507426  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2044  ammonium transporter, AmtB  49.88 
 
 
420 aa  318  9e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0927087  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  48.44 
 
 
416 aa  316  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  48.57 
 
 
415 aa  315  8e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0172  Rh family protein/ammonium transporter  51.23 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000030893  normal  0.412572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0522  Rh family protein/ammonium transporter  49.03 
 
 
423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  41.67 
 
 
511 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  40.72 
 
 
478 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  42.57 
 
 
468 aa  282  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  39.96 
 
 
506 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  40.17 
 
 
497 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  43.9 
 
 
408 aa  274  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  39.87 
 
 
478 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  42.29 
 
 
471 aa  273  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  43.46 
 
 
444 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  40.71 
 
 
584 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  39.32 
 
 
525 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  40.75 
 
 
446 aa  263  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  37.82 
 
 
518 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  40.51 
 
 
488 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  41.65 
 
 
486 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  40.69 
 
 
441 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  42.3 
 
 
435 aa  257  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  42.3 
 
 
435 aa  257  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  41.42 
 
 
486 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  41.42 
 
 
486 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  41.73 
 
 
461 aa  255  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  41.24 
 
 
496 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  42.07 
 
 
441 aa  254  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  40.33 
 
 
515 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  40.33 
 
 
515 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  41.24 
 
 
496 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  41.63 
 
 
482 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  42.21 
 
 
442 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  40.32 
 
 
476 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
717 aa  249  9e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  38.5 
 
 
490 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  39.86 
 
 
487 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  39.64 
 
 
507 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  41.55 
 
 
509 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  39.81 
 
 
512 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  38.16 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  39.04 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  40.52 
 
 
506 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  36.76 
 
 
391 aa  243  6e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  39.81 
 
 
462 aa  242  7.999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  41.01 
 
 
442 aa  242  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  39.76 
 
 
449 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  40.09 
 
 
507 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  41.73 
 
 
437 aa  240  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  39.29 
 
 
460 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  39.23 
 
 
445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  38.57 
 
 
441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  37.82 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0554  Rh-like protein/ammonium transporter  39.1 
 
 
439 aa  232  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.97 
 
 
1018 aa  229  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  39.64 
 
 
441 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  37.86 
 
 
1322 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.78 
 
 
1262 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  34.77 
 
 
644 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  37.62 
 
 
611 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  35.76 
 
 
1209 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.62 
 
 
1016 aa  219  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>