More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1318 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  100 
 
 
360 aa  715    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  64.12 
 
 
361 aa  425  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  51.59 
 
 
355 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  45.82 
 
 
350 aa  318  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  45.13 
 
 
362 aa  310  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  42.18 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  41.98 
 
 
374 aa  301  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  43.14 
 
 
348 aa  279  5e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  42.57 
 
 
348 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  39.51 
 
 
383 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  41.93 
 
 
354 aa  275  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  42.57 
 
 
348 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  38.61 
 
 
367 aa  269  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  41.31 
 
 
357 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  41.71 
 
 
349 aa  265  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  40 
 
 
357 aa  262  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  39.55 
 
 
355 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  40.12 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  41.14 
 
 
344 aa  252  6e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  36.47 
 
 
356 aa  252  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  39.94 
 
 
344 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  41.5 
 
 
363 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  38.73 
 
 
359 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  37.57 
 
 
370 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  40.12 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  37.57 
 
 
375 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  40.5 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  38.12 
 
 
358 aa  239  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  39.09 
 
 
357 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  40.06 
 
 
369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.73 
 
 
347 aa  233  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  37.54 
 
 
356 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  36.59 
 
 
356 aa  229  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.56 
 
 
336 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  36.72 
 
 
365 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.73 
 
 
347 aa  215  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  40.28 
 
 
361 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  42.01 
 
 
301 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  35.49 
 
 
331 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  37.47 
 
 
363 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  34.44 
 
 
356 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  38.68 
 
 
357 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  40.18 
 
 
340 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  34.46 
 
 
360 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  34.44 
 
 
356 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  36.87 
 
 
356 aa  206  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  34.87 
 
 
355 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  36.97 
 
 
357 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 
352 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.43 
 
 
337 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  33.33 
 
 
381 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  37.32 
 
 
347 aa  203  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  34.08 
 
 
354 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.71 
 
 
346 aa  202  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  37.06 
 
 
347 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  34.9 
 
 
360 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  36.09 
 
 
354 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  36 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  33.62 
 
 
371 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  32.56 
 
 
359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  41.64 
 
 
356 aa  199  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  37.43 
 
 
327 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 
380 aa  199  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  35.19 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  36.53 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  37.07 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  38.3 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  36.54 
 
 
340 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  35.08 
 
 
348 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  33.42 
 
 
375 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.15 
 
 
315 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  38.77 
 
 
351 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  34.31 
 
 
351 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3181  transport system permease protein  35.54 
 
 
382 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  32.39 
 
 
345 aa  189  8e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  35.78 
 
 
376 aa  189  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  33.93 
 
 
350 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  38.25 
 
 
366 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1895  iron chelate ABC transporter permease protein  38.25 
 
 
352 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2715  iron chelate ABC transporter permease protein  38.25 
 
 
371 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2033  iron compound ABC transporter, permease protein  38.25 
 
 
352 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.409984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  32.81 
 
 
352 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  37.07 
 
 
336 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0881  iron chelate ABC transporter permease protein  38.25 
 
 
371 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.626277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  33.82 
 
 
334 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3151  iron chelate ABC transporter permease protein  38.25 
 
 
371 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3190  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.25 
 
 
371 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3279  transport system permease protein  34.81 
 
 
381 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.7 
 
 
330 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3206  FecCD-family membrane transporter protein  38.25 
 
 
371 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.7 
 
 
330 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  32.77 
 
 
364 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0841  transport system permease protein  34.99 
 
 
382 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 
328 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  31.01 
 
 
343 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  36.39 
 
 
331 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  31.83 
 
 
385 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  35.13 
 
 
346 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  33.04 
 
 
346 aa  185  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>