More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1386 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  100 
 
 
396 aa  811  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  68.78 
 
 
397 aa  565  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  67.94 
 
 
396 aa  549  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  67.01 
 
 
398 aa  528  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  63.38 
 
 
417 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  63.5 
 
 
410 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  64.25 
 
 
410 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  63.43 
 
 
410 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  63.43 
 
 
410 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  63.43 
 
 
410 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  62.35 
 
 
420 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  63.45 
 
 
397 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  62.44 
 
 
405 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  61.98 
 
 
405 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  62.12 
 
 
399 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  62.12 
 
 
399 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  63.89 
 
 
399 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  64.66 
 
 
387 aa  505  1e-142  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2017  succinyldiaminopimelate transaminase  61.46 
 
 
420 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  60.5 
 
 
434 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  64.14 
 
 
410 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  62.34 
 
 
405 aa  501  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  61.21 
 
 
402 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2068  succinyldiaminopimelate transaminase  62.72 
 
 
410 aa  494  1e-138  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.854431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2448  succinyldiaminopimelate transaminase  62.47 
 
 
410 aa  492  1e-138  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.805274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1565  succinyldiaminopimelate transaminase  62.47 
 
 
415 aa  491  1e-138  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  62.72 
 
 
410 aa  494  1e-138  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2504  succinyldiaminopimelate transaminase  62.72 
 
 
410 aa  494  1e-138  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  61.31 
 
 
407 aa  494  1e-138  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  63 
 
 
403 aa  494  1e-138  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3244  succinyldiaminopimelate transaminase  62.72 
 
 
410 aa  494  1e-138  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667849  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  61.27 
 
 
400 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  61.21 
 
 
400 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  60.49 
 
 
409 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  60.71 
 
 
401 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  60.2 
 
 
409 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  62.72 
 
 
404 aa  475  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  62.97 
 
 
404 aa  475  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  59.59 
 
 
399 aa  465  1e-130  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  59.95 
 
 
402 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  58.52 
 
 
397 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  59.24 
 
 
398 aa  459  1e-128  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  59.45 
 
 
402 aa  459  1e-128  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  56.63 
 
 
407 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  57.51 
 
 
397 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  56.96 
 
 
398 aa  453  1e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  56.96 
 
 
398 aa  454  1e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  56.71 
 
 
399 aa  453  1e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  57.25 
 
 
398 aa  446  1e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  56.74 
 
 
398 aa  447  1e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  57.64 
 
 
398 aa  445  1e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  56.31 
 
 
401 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  57 
 
 
398 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  56.6 
 
 
399 aa  441  1e-122  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  56.96 
 
 
396 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  55.1 
 
 
400 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  50.51 
 
 
395 aa  408  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  54.29 
 
 
397 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  50.12 
 
 
408 aa  405  1e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  49.28 
 
 
412 aa  407  1e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  53.9 
 
 
399 aa  400  1e-110  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  49.14 
 
 
409 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  50.25 
 
 
399 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  48.36 
 
 
405 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  52.15 
 
 
406 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  52.15 
 
 
401 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  43.77 
 
 
398 aa  304  2e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2899  aminotransferase, class I and II  43.15 
 
 
392 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24547  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  43.39 
 
 
392 aa  288  9e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0427  aminotransferase  41.91 
 
 
393 aa  286  6e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1494  aminotransferase  41.86 
 
 
392 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0144  aminotransferase, class I and II  41.6 
 
 
392 aa  285  1e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.680923  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3706  aminotransferase  39.25 
 
 
460 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0060  aminotransferase class I and II  41.4 
 
 
393 aa  275  1e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119317  hitchhiker  3.2787e-06 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0132  aminotransferase  40 
 
 
404 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0445  aminotransferase, class I and II  43.41 
 
 
412 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0759  hypothetical protein  41.03 
 
 
378 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0275  aminotransferase, class I and II  40.72 
 
 
438 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1301  aminotransferase class I and II  38.56 
 
 
413 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.54822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0376  aminotransferase, class I and II  41.97 
 
 
420 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0089  aminotransferase, class I and II  40.57 
 
 
423 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789487  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  39.16 
 
 
376 aa  254  2e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2672  aminotransferase, class I and II  41.62 
 
 
397 aa  254  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  39.53 
 
 
423 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0281  aminotransferase class I and II  40.15 
 
 
408 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0769639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1842  aminotransferase class I and II  37.66 
 
 
416 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.134959  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 
386 aa  214  2e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.19 
 
 
405 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  32.03 
 
 
388 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 
396 aa  174  2e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  31.77 
 
 
383 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  31.79 
 
 
379 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.86388e-05 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  31.09 
 
 
396 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 
359 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.56 
 
 
370 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  30.56 
 
 
388 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  31.44 
 
 
384 aa  164  2e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  32.24 
 
 
403 aa  164  2e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.06 
 
 
388 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.25 
 
 
387 aa  163  4e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>