99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0446 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5964  amino acid permease-associated region  69.96 
 
 
559 aa  781    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3183  amino acid permease-associated region  67.89 
 
 
560 aa  790    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.577712  normal  0.0276792 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5970  amino acid permease-associated region  58.71 
 
 
546 aa  668    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699386  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0446  amino acid permease-associated region  100 
 
 
562 aa  1125    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000198962  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4487  amino acid permease-associated region  54.8 
 
 
551 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3293  amino acid permease-associated region  54.8 
 
 
551 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5012  amino acid permease-associated region  54.98 
 
 
551 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5210  amino acid permease-associated region  54.98 
 
 
551 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749759  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5831  amino acid permease-associated region  55.31 
 
 
545 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5075  amino acid permease-associated region  54.8 
 
 
551 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0581  amino acid transporter  54.98 
 
 
551 aa  621  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1858  amino acid transporter, putative  55.81 
 
 
551 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540964  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0996  amino acid permease  55.81 
 
 
551 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858254  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0750  amino acid permease  55.81 
 
 
551 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2118  hypothetical protein  55.81 
 
 
551 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.755576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0838  amino acid permease  55.81 
 
 
551 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1969  amino acid permease  55.81 
 
 
551 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3557  amino acid permease-associated region  54.27 
 
 
551 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0700  amino acid permease  55.81 
 
 
551 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0481  putative amino acid transporter  55.81 
 
 
551 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.483178  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4239  amino acid permease-associated region  54.77 
 
 
551 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0922  amino acid permease-associated region  52.52 
 
 
571 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3293  amino acid permease-associated region  54.31 
 
 
555 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3606  amino acid permease-associated region  53.71 
 
 
571 aa  585  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5657  amino acid permease-associated region  49.51 
 
 
594 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675998  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6593  amino acid permease-associated region  49.18 
 
 
594 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000438666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3317  amino acid permease-associated region  49.08 
 
 
594 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23200  amino acid transporter  39.74 
 
 
541 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3606  amino acid permease  30.98 
 
 
508 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.582205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2292  amino acid transporter  29.59 
 
 
500 aa  170  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5040  Amino acid transporter-like protein  23.18 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 
473 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 
490 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 
499 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 
490 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 
455 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  21.68 
 
 
472 aa  57  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  27.44 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 
516 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  24.75 
 
 
486 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  27.44 
 
 
482 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 
494 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  27.44 
 
 
482 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  26.98 
 
 
482 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  25.25 
 
 
467 aa  53.9  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  26.88 
 
 
480 aa  53.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 
500 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 
555 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  24.37 
 
 
427 aa  50.8  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  23.04 
 
 
517 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  25.75 
 
 
532 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 
490 aa  48.5  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  23.61 
 
 
482 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 
532 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 
480 aa  48.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  22.04 
 
 
482 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  22.04 
 
 
482 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 
506 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 
468 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  21.22 
 
 
474 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1349  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 
490 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923637  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1332  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 
490 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1368  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 
490 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  24.91 
 
 
532 aa  47.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  23.61 
 
 
482 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 
483 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04890  amino acid transporter  29.55 
 
 
458 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  24.3 
 
 
464 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 
549 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
502 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  23.05 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  23.56 
 
 
418 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  24.3 
 
 
464 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  21.35 
 
 
475 aa  46.2  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  22.92 
 
 
522 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 
452 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  23.7 
 
 
473 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 
490 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  23.99 
 
 
473 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 
455 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  31.75 
 
 
474 aa  45.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 
500 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 
486 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 
494 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 
496 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 
543 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  24.05 
 
 
487 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 
530 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  24.05 
 
 
487 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  22.58 
 
 
495 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 
490 aa  44.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  21.63 
 
 
483 aa  44.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  25.45 
 
 
486 aa  44.3  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 
451 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  23.25 
 
 
499 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  24.34 
 
 
461 aa  43.5  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.29 
 
 
463 aa  43.9  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>