More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl652 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl652  putative sodium-glutamate symporter  100 
 
 
585 aa  1156    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0857  proton/glutamate symporter family protein  51.13 
 
 
522 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0025  sodium/dicarboxylate symporter  29.53 
 
 
461 aa  164  6e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181863  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0052  sodium/dicarboxylate symporter  29.53 
 
 
461 aa  164  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0027  sodium/dicarboxylate symporter  29.59 
 
 
461 aa  159  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  29.71 
 
 
450 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  30 
 
 
435 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.39 
 
 
435 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1200  sodium:dicarboxylate symporter  28.28 
 
 
464 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  29.95 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0480  sodium:dicarboxylate symporter  26.56 
 
 
428 aa  135  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0200306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  28.31 
 
 
409 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02783  hypothetical protein  27.85 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  30.4 
 
 
434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  27.23 
 
 
436 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  29.5 
 
 
434 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  27.01 
 
 
436 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0130  sodium/dicarboxylate symporter family protein  25.31 
 
 
457 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000347492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  28.12 
 
 
411 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.12 
 
 
411 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  28.12 
 
 
411 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  28.12 
 
 
411 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.12 
 
 
411 aa  124  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  28.31 
 
 
411 aa  124  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  27.59 
 
 
411 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  29.24 
 
 
434 aa  123  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1813  sodium/dicarboxylate symporter  27.96 
 
 
456 aa  123  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0716204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  28 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  25.59 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  27.84 
 
 
436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  30.42 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  29.5 
 
 
433 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  27.32 
 
 
411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  26.58 
 
 
411 aa  120  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2041  sodium:dicarboxylate symporter  27.54 
 
 
463 aa  120  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0258833  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  29.56 
 
 
444 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1093  sodium:dicarboxylate symporter  27.53 
 
 
425 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  27.47 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  26.91 
 
 
442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  30.24 
 
 
436 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  29.74 
 
 
435 aa  118  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  29.56 
 
 
444 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  29.31 
 
 
444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  29.44 
 
 
440 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  29.05 
 
 
444 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  29.44 
 
 
440 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  29.44 
 
 
435 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  26.12 
 
 
430 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02122  hypothetical protein  25.38 
 
 
457 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  26.07 
 
 
439 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  26.05 
 
 
437 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  27.79 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  25.66 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0856  sodium/dicarboxylate symporter  26.27 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  25.76 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  26.01 
 
 
457 aa  115  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  28.15 
 
 
433 aa  115  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  27.72 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  26.89 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  27.85 
 
 
417 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  28.54 
 
 
437 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  28.42 
 
 
443 aa  113  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2193  sodium:dicarboxylate symporter  28.13 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  26.28 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003695  sodium/dicarboxylate symporter  25.12 
 
 
457 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1962  sodium:dicarboxylate symporter  26.53 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  26.94 
 
 
440 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  25.65 
 
 
457 aa  112  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  25.96 
 
 
437 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  26.03 
 
 
449 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.15 
 
 
437 aa  110  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  25.77 
 
 
452 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  26.33 
 
 
440 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  26.33 
 
 
440 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  27.22 
 
 
409 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  26.86 
 
 
440 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  30.2 
 
 
427 aa  110  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  25.98 
 
 
437 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5183  sodium:dicarboxylate symporter  25.61 
 
 
463 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337682  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  25.81 
 
 
439 aa  109  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4249  sodium:dicarboxylate symporter  28.05 
 
 
462 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  25.95 
 
 
419 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1900  sodium:dicarboxylate symporter  27 
 
 
464 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  25.95 
 
 
419 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  25.95 
 
 
419 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  25.95 
 
 
419 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  27.77 
 
 
448 aa  107  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  31.57 
 
 
434 aa  107  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5131  sodium:dicarboxylate symporter  25.43 
 
 
463 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  26.06 
 
 
405 aa  107  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  25.12 
 
 
427 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  26.19 
 
 
449 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2651  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.7 
 
 
463 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.342663  normal  0.0129409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  26.63 
 
 
441 aa  106  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  26.32 
 
 
419 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  26.75 
 
 
438 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  26.03 
 
 
416 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  26.89 
 
 
424 aa  106  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5004  sodium:dicarboxylate symporter  25.68 
 
 
463 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143079  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1685  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.7 
 
 
463 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.24446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>