More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0130 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0130  sodium/dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 
457 aa  902    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000347492  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1200  sodium:dicarboxylate symporter  49.43 
 
 
464 aa  413  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2975  sodium:dicarboxylate symporter  50.88 
 
 
463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0873777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4148  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000696352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3988  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50.22 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.04073e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4469  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4267  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4377  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50 
 
 
464 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000178657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4324  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50 
 
 
464 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000495156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4100  sodium:dicarboxylate symporter  49.45 
 
 
464 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0682  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 
465 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0876  sodium:dicarboxylate symporter family protein  49.56 
 
 
464 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000242898  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4358  sodium:dicarboxylate symporter family protein  49.56 
 
 
464 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0856  sodium/dicarboxylate symporter  46 
 
 
471 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0063  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.96 
 
 
462 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00246087  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003695  sodium/dicarboxylate symporter  46.91 
 
 
457 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1813  sodium/dicarboxylate symporter  45.02 
 
 
456 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0716204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02122  hypothetical protein  46.73 
 
 
457 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0324  sodium:dicarboxylate symporter  46.65 
 
 
455 aa  365  1e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1380  sodium:dicarboxylate symporter  45.68 
 
 
462 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379298  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1962  sodium:dicarboxylate symporter  44.62 
 
 
463 aa  359  5e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152982  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2041  sodium:dicarboxylate symporter  45.48 
 
 
463 aa  359  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0258833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0442  sodium:dicarboxylate symporter  47.71 
 
 
462 aa  359  7e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000381157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0431  sodium:dicarboxylate symporter  47.71 
 
 
462 aa  359  7e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000163479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0981  sodium:dicarboxylate symporter  44.7 
 
 
463 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.216579  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1851  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  45.13 
 
 
463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0377279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1316  sodium:dicarboxylate symporter  45.77 
 
 
462 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.539428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1685  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.08 
 
 
463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.24446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1795  sodium:dicarboxylate symporter  45.08 
 
 
463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2651  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.85 
 
 
463 aa  352  8.999999999999999e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.342663  normal  0.0129409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5360  Sodium:dicarboxylate symporter  44.39 
 
 
463 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2024  sodium:dicarboxylate symporter family protein  47.42 
 
 
463 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.546812  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2123  sodium:dicarboxylate symporter  46.41 
 
 
463 aa  345  7e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00153943  decreased coverage  0.000144884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1434  sodium:dicarboxylate symporter family  47.42 
 
 
463 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1449  sodium:dicarboxylate symporter family  47.42 
 
 
463 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4249  sodium:dicarboxylate symporter  45.87 
 
 
462 aa  345  8.999999999999999e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  42.48 
 
 
480 aa  345  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000719973  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1417  sodium:dicarboxylate symporter family  47.17 
 
 
463 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977711  normal  0.0168529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1462  sodium/dicarboxylate symporter family protein  46.31 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.726866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01698  predicted transporter  46.31 
 
 
463 aa  343  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.770973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1913  sodium:dicarboxylate symporter  46.31 
 
 
463 aa  343  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0453037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1810  sodium/dicarboxylate symporter family protein  46.31 
 
 
463 aa  343  5e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2447  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  46.31 
 
 
463 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1903  sodium:dicarboxylate symporter  46.31 
 
 
463 aa  343  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1974  sodium:dicarboxylate symporter family  46.31 
 
 
463 aa  343  5e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01686  hypothetical protein  46.31 
 
 
463 aa  343  5e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.709568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1950  sodium/dicarboxylate symporter family protein  45.81 
 
 
463 aa  341  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1900  sodium:dicarboxylate symporter  47.04 
 
 
464 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2193  sodium:dicarboxylate symporter  46.8 
 
 
464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1714  sodium:dicarboxylate symporter  45.8 
 
 
463 aa  340  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.424207  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0365  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  44.91 
 
 
451 aa  339  7e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2153  sodium:dicarboxylate symporter  44.84 
 
 
470 aa  335  7.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0754  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family protein  45.75 
 
 
463 aa  335  9e-91  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.7297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5131  sodium:dicarboxylate symporter  45.19 
 
 
463 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5183  sodium:dicarboxylate symporter  44.94 
 
 
463 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337682  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5004  sodium:dicarboxylate symporter  45.19 
 
 
463 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143079  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02783  hypothetical protein  43.45 
 
 
468 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0334  sodium:dicarboxylate symporter  42.79 
 
 
463 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1461  sodium:dicarboxylate symporter  42.96 
 
 
451 aa  319  7.999999999999999e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000388581  normal  0.0381632 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1974  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family protein  40.84 
 
 
448 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  hitchhiker  0.000000330732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1481  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family transporter  40.84 
 
 
448 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175987  hitchhiker  0.00000339976 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1803  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family  40.59 
 
 
448 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1465  transporter dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family  40.84 
 
 
448 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.361022  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1500  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family protein  40.59 
 
 
448 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000799891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  32.67 
 
 
444 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  33.48 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.01 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  32.01 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0025  sodium/dicarboxylate symporter  33.11 
 
 
461 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181863  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0052  sodium/dicarboxylate symporter  33.11 
 
 
461 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0027  sodium/dicarboxylate symporter  32.37 
 
 
461 aa  193  6e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  30.54 
 
 
437 aa  179  8e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  30.54 
 
 
437 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  30.37 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  30.07 
 
 
413 aa  162  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  29.47 
 
 
437 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  27.95 
 
 
436 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  29.98 
 
 
441 aa  159  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0480  sodium:dicarboxylate symporter  29.38 
 
 
428 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  30.62 
 
 
419 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  30.62 
 
 
419 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  30.62 
 
 
419 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  28.93 
 
 
430 aa  157  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  31.06 
 
 
427 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  31.14 
 
 
419 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  29.86 
 
 
417 aa  156  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  30.11 
 
 
416 aa  156  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  29.45 
 
 
437 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  27.84 
 
 
437 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  28.64 
 
 
442 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  29.45 
 
 
437 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  31.03 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  28.18 
 
 
436 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  28.47 
 
 
440 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  28.95 
 
 
410 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  28.47 
 
 
440 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  28.47 
 
 
440 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  28.38 
 
 
440 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  28.89 
 
 
443 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>