More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0857 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0857  proton/glutamate symporter family protein  100 
 
 
522 aa  1023    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl652  putative sodium-glutamate symporter  51.13 
 
 
585 aa  411  1e-113  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1200  sodium:dicarboxylate symporter  26.51 
 
 
464 aa  146  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0027  sodium/dicarboxylate symporter  27.71 
 
 
461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0025  sodium/dicarboxylate symporter  27.25 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181863  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0052  sodium/dicarboxylate symporter  27.25 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0480  sodium:dicarboxylate symporter  27.13 
 
 
428 aa  124  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0200306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  27.47 
 
 
409 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  26.59 
 
 
450 aa  120  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.54 
 
 
437 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  24.3 
 
 
433 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  25.05 
 
 
437 aa  114  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  26.39 
 
 
436 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  27.3 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.3 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  24.67 
 
 
437 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  27.23 
 
 
445 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  27.53 
 
 
411 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  27.57 
 
 
424 aa  110  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  27.01 
 
 
411 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  27.01 
 
 
411 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.01 
 
 
411 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  27.01 
 
 
411 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  27.01 
 
 
411 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.01 
 
 
411 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  25.98 
 
 
424 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  26.75 
 
 
411 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  25.3 
 
 
452 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  26.96 
 
 
409 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  24.78 
 
 
436 aa  109  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  24.28 
 
 
440 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  26.49 
 
 
411 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  23.97 
 
 
436 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  23.97 
 
 
437 aa  107  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  26.45 
 
 
419 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  26.45 
 
 
419 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  24.56 
 
 
440 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  24.56 
 
 
440 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  26.12 
 
 
416 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  24.61 
 
 
434 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  26.45 
 
 
419 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  24.78 
 
 
440 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  26.45 
 
 
419 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  27.16 
 
 
443 aa  106  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  26.23 
 
 
411 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4100  sodium:dicarboxylate symporter  23.06 
 
 
464 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  25 
 
 
445 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  23.84 
 
 
427 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  26.82 
 
 
444 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  26.47 
 
 
411 aa  104  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  25.12 
 
 
416 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  26.07 
 
 
433 aa  104  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  26.03 
 
 
440 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  26.57 
 
 
444 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  26.1 
 
 
440 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  27.11 
 
 
444 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  25.51 
 
 
434 aa  103  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  26.25 
 
 
402 aa  103  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4324  sodium:dicarboxylate symporter family protein  22.64 
 
 
464 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000495156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4358  sodium:dicarboxylate symporter family protein  22.85 
 
 
464 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  26.32 
 
 
444 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4377  sodium:dicarboxylate symporter family protein  22.64 
 
 
464 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000178657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  26.32 
 
 
449 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0876  sodium:dicarboxylate symporter family protein  22.85 
 
 
464 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000242898  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2975  sodium:dicarboxylate symporter  22.27 
 
 
463 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0873777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2041  sodium:dicarboxylate symporter  24.26 
 
 
463 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0258833  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02783  hypothetical protein  24.02 
 
 
468 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  27.39 
 
 
435 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4148  sodium:dicarboxylate symporter family protein  22.64 
 
 
464 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000696352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  22.64 
 
 
464 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000216588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4267  sodium:dicarboxylate symporter family protein  22.64 
 
 
464 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4469  sodium:dicarboxylate symporter family protein  22.64 
 
 
464 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3988  sodium:dicarboxylate symporter family protein  22.43 
 
 
464 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.04073e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  25.54 
 
 
425 aa  100  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1962  sodium:dicarboxylate symporter  24.34 
 
 
463 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152982  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2153  sodium:dicarboxylate symporter  24.69 
 
 
470 aa  99.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  24.01 
 
 
457 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  25.99 
 
 
417 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1093  sodium:dicarboxylate symporter  27.59 
 
 
425 aa  98.6  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  23.78 
 
 
457 aa  99  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  23.64 
 
 
442 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0063  sodium:dicarboxylate symporter family protein  23.23 
 
 
462 aa  98.6  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00246087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  24.22 
 
 
447 aa  98.2  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  23.8 
 
 
441 aa  98.2  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  25.77 
 
 
410 aa  97.8  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  25.98 
 
 
417 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  27.63 
 
 
430 aa  97.8  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  24.78 
 
 
432 aa  97.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  26.13 
 
 
417 aa  97.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  25.67 
 
 
413 aa  97.4  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  26.54 
 
 
438 aa  97.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  25.98 
 
 
417 aa  97.1  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  22.11 
 
 
480 aa  96.7  8e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000719973  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  22.92 
 
 
457 aa  96.7  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  25.67 
 
 
419 aa  96.7  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  26.07 
 
 
432 aa  96.3  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2651  sodium:dicarboxylate symporter family protein  24.31 
 
 
463 aa  95.5  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.342663  normal  0.0129409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  24.11 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1795  sodium:dicarboxylate symporter  24.31 
 
 
463 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  24.76 
 
 
436 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>