More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0063 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0442  sodium:dicarboxylate symporter  84.16 
 
 
462 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000381157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0063  sodium:dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 
462 aa  917    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00246087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0431  sodium:dicarboxylate symporter  84.16 
 
 
462 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000163479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4100  sodium:dicarboxylate symporter  54.61 
 
 
464 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2975  sodium:dicarboxylate symporter  54.68 
 
 
463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0873777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4324  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.39 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000495156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4148  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.61 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000696352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3988  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.39 
 
 
464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.04073e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.61 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4469  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.61 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0876  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.61 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000242898  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4267  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.61 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4377  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.39 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000178657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4358  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.61 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0682  sodium:dicarboxylate symporter  53.79 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682862  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  49.89 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000719973  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0981  sodium:dicarboxylate symporter  47.58 
 
 
463 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.216579  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1200  sodium:dicarboxylate symporter  45.27 
 
 
464 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1795  sodium:dicarboxylate symporter  49 
 
 
463 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02122  hypothetical protein  47.31 
 
 
457 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1685  sodium:dicarboxylate symporter family protein  49 
 
 
463 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.24446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0130  sodium/dicarboxylate symporter family protein  44.96 
 
 
457 aa  391  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000347492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2123  sodium:dicarboxylate symporter  48.25 
 
 
463 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00153943  decreased coverage  0.000144884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1962  sodium:dicarboxylate symporter  47.67 
 
 
463 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152982  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2651  sodium:dicarboxylate symporter family protein  48.78 
 
 
463 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.342663  normal  0.0129409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1813  sodium/dicarboxylate symporter  45.01 
 
 
456 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0716204  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1851  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  48.02 
 
 
463 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0377279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2041  sodium:dicarboxylate symporter  47.77 
 
 
463 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0258833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0856  sodium/dicarboxylate symporter  44.25 
 
 
471 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0324  sodium:dicarboxylate symporter  48.44 
 
 
455 aa  387  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003695  sodium/dicarboxylate symporter  45.87 
 
 
457 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01698  predicted transporter  47.81 
 
 
463 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.770973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1913  sodium:dicarboxylate symporter  47.81 
 
 
463 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0453037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1810  sodium/dicarboxylate symporter family protein  47.81 
 
 
463 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2447  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  47.81 
 
 
463 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2153  sodium:dicarboxylate symporter  48.03 
 
 
470 aa  385  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1903  sodium:dicarboxylate symporter  47.81 
 
 
463 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01686  hypothetical protein  47.81 
 
 
463 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.709568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1950  sodium/dicarboxylate symporter family protein  47.37 
 
 
463 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1462  sodium/dicarboxylate symporter family protein  47.59 
 
 
463 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.726866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1974  sodium:dicarboxylate symporter family  47.81 
 
 
463 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1434  sodium:dicarboxylate symporter family  48.03 
 
 
463 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1449  sodium:dicarboxylate symporter family  48.03 
 
 
463 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4249  sodium:dicarboxylate symporter  45.61 
 
 
462 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2024  sodium:dicarboxylate symporter family protein  48.56 
 
 
463 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.546812  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1417  sodium:dicarboxylate symporter family  48.24 
 
 
463 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977711  normal  0.0168529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0334  sodium:dicarboxylate symporter  47.7 
 
 
463 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1714  sodium:dicarboxylate symporter  48.4 
 
 
463 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.424207  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1380  sodium:dicarboxylate symporter  47.07 
 
 
462 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379298  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1316  sodium:dicarboxylate symporter  46.83 
 
 
462 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.539428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5360  Sodium:dicarboxylate symporter  45.48 
 
 
463 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2193  sodium:dicarboxylate symporter  49.16 
 
 
464 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1900  sodium:dicarboxylate symporter  48.43 
 
 
464 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5183  sodium:dicarboxylate symporter  47.34 
 
 
463 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337682  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02783  hypothetical protein  40.83 
 
 
468 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5004  sodium:dicarboxylate symporter  47.34 
 
 
463 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143079  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5131  sodium:dicarboxylate symporter  47.34 
 
 
463 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0754  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family protein  45.52 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.7297  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0365  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  46.4 
 
 
451 aa  336  7e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1461  sodium:dicarboxylate symporter  47.36 
 
 
451 aa  326  6e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000388581  normal  0.0381632 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1974  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family protein  42.55 
 
 
448 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  hitchhiker  0.000000330732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1500  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family protein  42.79 
 
 
448 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000799891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1481  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family transporter  42.55 
 
 
448 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175987  hitchhiker  0.00000339976 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1465  transporter dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family  42.79 
 
 
448 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.361022  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1803  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family  42.32 
 
 
448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260998  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0025  sodium/dicarboxylate symporter  32.46 
 
 
461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181863  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0052  sodium/dicarboxylate symporter  32.46 
 
 
461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0027  sodium/dicarboxylate symporter  32.54 
 
 
461 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31.18 
 
 
435 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.91 
 
 
435 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  30.58 
 
 
439 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  29.69 
 
 
444 aa  177  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  28.7 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  27.42 
 
 
450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  28.22 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  27.99 
 
 
437 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  26.19 
 
 
437 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.9 
 
 
437 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  26.65 
 
 
445 aa  161  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  25.96 
 
 
440 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  25.96 
 
 
440 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  25.9 
 
 
437 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  25.73 
 
 
440 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  25.85 
 
 
437 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  25.96 
 
 
440 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  26.97 
 
 
436 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  28.87 
 
 
447 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0480  sodium:dicarboxylate symporter  29.33 
 
 
428 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0200306  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  28.25 
 
 
434 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  25.92 
 
 
436 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  26.01 
 
 
436 aa  153  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  28.41 
 
 
413 aa  153  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  25.79 
 
 
442 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  26.85 
 
 
409 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  25.81 
 
 
430 aa  152  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  27 
 
 
451 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  27.99 
 
 
419 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  27.99 
 
 
419 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  27.99 
 
 
419 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  27.99 
 
 
419 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>