More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1804 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 291 aa  594  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  97.94 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  94.85 
 
 		 291 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  81.44 
 
 		 291 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  76.29 
 
 		 291 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  66.3 
 
 		 278 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  66.06 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  62.82 
 
 		 275 aa  353  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  58.13 
 
 		 291 aa  350  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  61.05 
 
 		 295 aa  348  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  61.46 
 
 		 290 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  59.18 
 
 		 302 aa  341  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  57.64 
 
 		 294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  57.73 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  57.09 
 
 		 291 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  61.6 
 
 		 275 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  57.35 
 
 		 275 aa  332  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  56.45 
 
 		 290 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  57.99 
 
 		 290 aa  331  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  59.79 
 
 		 297 aa  330  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  59.79 
 
 		 297 aa  330  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  57.19 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  56.47 
 
 		 275 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  60.69 
 
 		 278 aa  328  7e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  60.15 
 
 		 300 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  57.29 
 
 		 291 aa  324  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  54.58 
 
 		 293 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  58.67 
 
 		 290 aa  323  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  58.67 
 
 		 290 aa  322  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  58.67 
 
 		 290 aa  322  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  58.02 
 
 		 268 aa  322  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  54.7 
 
 		 290 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  55.76 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  55.6 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  55.6 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  55.76 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  55.39 
 
 		 269 aa  318  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  54.85 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  54.85 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  55.22 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  54.51 
 
 		 291 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  54.51 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  54.48 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  54.51 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  54.51 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  54.51 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  54.51 
 
 		 339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  56.2 
 
 		 290 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  57.25 
 
 		 275 aa  311  6.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  53.22 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  50.18 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  54.61 
 
 		 291 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  54.61 
 
 		 291 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  54.61 
 
 		 291 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  54.61 
 
 		 291 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  53.47 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  53.12 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  51.89 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  51.89 
 
 		 292 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  51.39 
 
 		 291 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  50.35 
 
 		 291 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  50.35 
 
 		 291 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  50.35 
 
 		 291 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  56.35 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  52.99 
 
 		 270 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  50 
 
 		 291 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  51.03 
 
 		 291 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  50.17 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  36.25 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.92 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  35.74 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.27 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  36.59 
 
 		 239 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  30.38 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  33.19 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  37.24 
 
 		 246 aa  126  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  31.56 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  30.65 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  34.38 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  34.38 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 		 245 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  34.78 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  36.55 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  32.41 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  37.96 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  32.71 
 
 		 254 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  33.09 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  32.27 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  30.2 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  33.75 
 
 		 227 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  34.87 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 254 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  31.58 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  32.9 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  33.62 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  31.27 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>