More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1999 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 292 aa  595  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  61.9 
 
 		 298 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  54.05 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  39.52 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  30.09 
 
 		 328 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  40.58 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  35.49 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  34.83 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  34.24 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  33.67 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  35.62 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  35.27 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  35.44 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  35.66 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.92 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.92 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  30.45 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 353 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  33.57 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  32.2 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  34.19 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  34.16 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  36.33 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  30.84 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  33.81 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  33.94 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  30.85 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30.88 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  34.19 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  31.18 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  31.65 
 
 		 347 aa  142  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  27.83 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  29.86 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.6 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  31.47 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  31.65 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  32.01 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  28.27 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.62 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.35 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  29.53 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  29.27 
 
 		 309 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  30.85 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.03 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  34.41 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  28.07 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  33.6 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  27.78 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.19 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  31.27 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  26.19 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  26.99 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  32.41 
 
 		 365 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 371 aa  132  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  27.85 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  28.62 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  28.99 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  28.99 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  32.36 
 
 		 341 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  27.08 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.47 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  32.85 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  30.11 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.67 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  35.06 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  34.55 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  32.08 
 
 		 344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  29.33 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  32.32 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  27.14 
 
 		 326 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  32.54 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  30.26 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  26.2 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  29.18 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  29.52 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  30.3 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  31.54 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  35.9 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>