More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1554 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 357 aa  688    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1919  rod shape-determining protein RodA  64.8 
 
 		 360 aa  430  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403487  hitchhiker  0.000000909205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  39.44 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  36.87 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  40.27 
 
 		 377 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  37.7 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  36.25 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.54 
 
 		 379 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  46.48 
 
 		 384 aa  218  8.999999999999998e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  37.26 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  37.29 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  38.63 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  39.78 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  38.57 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  37.7 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  38.69 
 
 		 378 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  42.27 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 390 aa  215  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 390 aa  215  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  40.44 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  38.74 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  41.62 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  38.74 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  40.23 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 373 aa  212  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  37.64 
 
 		 366 aa  212  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  39.04 
 
 		 386 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  39.39 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  39.55 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  39.08 
 
 		 388 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  39.35 
 
 		 373 aa  209  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  39.3 
 
 		 379 aa  208  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  38.81 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0240  rod shape-determining protein RodA  42.32 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  37.69 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  36.93 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  42.39 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  37.22 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  38.53 
 
 		 367 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  38.53 
 
 		 367 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  38.29 
 
 		 367 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  40.69 
 
 		 368 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 386 aa  205  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  38.83 
 
 		 378 aa  205  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  38.35 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  38.98 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  46.69 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  38.98 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  38.87 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  38.98 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  38.98 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  33.92 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  34.82 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  38.01 
 
 		 385 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  37.39 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  34.25 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  33.92 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  41.96 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 371 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  38.59 
 
 		 371 aa  202  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  41.84 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  43.21 
 
 		 376 aa  202  9e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  35.69 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1091  rod shape-determining protein RodA  39.56 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  39.29 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  37.15 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  36.71 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  38.74 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  39.72 
 
 		 368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  39.57 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  37.19 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  42.39 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  37.71 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  41.05 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  41.05 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  38.38 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  41.05 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  43.69 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  39.67 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  34.25 
 
 		 423 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  42.05 
 
 		 412 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2391  cell cycle protein FtsW  37.4 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00202721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2103  cell cycle protein FtsW  37.4 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000319192  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  39.12 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  42.19 
 
 		 380 aa  196  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  41.81 
 
 		 371 aa  196  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  39.12 
 
 		 382 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>