239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0366 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  795    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  48.95 
 
 
384 aa  358  9e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  47.11 
 
 
382 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  38.64 
 
 
379 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  39.53 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  37.5 
 
 
375 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  38.2 
 
 
382 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  35.42 
 
 
376 aa  250  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  36.96 
 
 
382 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  35.88 
 
 
398 aa  242  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  37.63 
 
 
383 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  36.53 
 
 
377 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  37.99 
 
 
375 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  36.81 
 
 
376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  36.53 
 
 
398 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  39.1 
 
 
376 aa  215  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  35.31 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  33.51 
 
 
378 aa  212  7.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  34.91 
 
 
379 aa  210  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  34.88 
 
 
451 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  33.85 
 
 
382 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  33.59 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  36 
 
 
385 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  37.23 
 
 
378 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  35.88 
 
 
378 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  33.08 
 
 
396 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  31.28 
 
 
396 aa  155  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  29.3 
 
 
371 aa  152  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  32.24 
 
 
315 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  30.03 
 
 
323 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  31.95 
 
 
319 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  31.58 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  32.96 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  29.35 
 
 
318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  31.85 
 
 
261 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  31.85 
 
 
261 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  28.91 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  29.93 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  32.34 
 
 
293 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  32.99 
 
 
330 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  32.7 
 
 
316 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.46 
 
 
618 aa  99.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  30.08 
 
 
293 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  27.93 
 
 
328 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  29.67 
 
 
293 aa  96.3  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  28.47 
 
 
294 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  28.33 
 
 
303 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  30 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  28.19 
 
 
347 aa  89.7  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  26.67 
 
 
306 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  30.62 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  30.5 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  26.91 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  28.95 
 
 
318 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  28.03 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  27.73 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  26.86 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  29.07 
 
 
309 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  26.69 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  27.95 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  30.52 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  28.09 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  26.19 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  25.78 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  28.46 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  29.52 
 
 
260 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  32.48 
 
 
639 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  31.91 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  28.21 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  26.19 
 
 
505 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  26.46 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  25.54 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  26.64 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1215  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.62 
 
 
368 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.62 
 
 
368 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  38.81 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.07 
 
 
368 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  25.48 
 
 
375 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0570  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  32.26 
 
 
87 aa  53.5  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1530  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48 
 
 
95 aa  53.5  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.753376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  25.48 
 
 
375 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.49 
 
 
368 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.45 
 
 
421 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2618  sulfite reductase, beta subunit  36.92 
 
 
285 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.433957 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  46.3 
 
 
526 aa  53.1  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  33.73 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  25.19 
 
 
301 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.06 
 
 
55 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  43.4 
 
 
594 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 
367 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  23.9 
 
 
308 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  25.97 
 
 
433 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.87 
 
 
287 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1109  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.73 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.195082  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.15 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0885  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  39.29 
 
 
267 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0213138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  24.03 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  47.06 
 
 
614 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 
357 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0429  hypothetical protein  34.19 
 
 
367 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>