More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0486 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 454 aa  870    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  88.58 
 
 		 438 aa  691    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  98.35 
 
 		 425 aa  804    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  66.37 
 
 		 459 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  67.59 
 
 		 447 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  64.63 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  54.67 
 
 		 448 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  54.78 
 
 		 463 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  52.28 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  49.45 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  50.66 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  49 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  49.45 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  51.02 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  50.45 
 
 		 493 aa  359  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  50.66 
 
 		 450 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  49.12 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  47.68 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.86 
 
 		 470 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  47.39 
 
 		 462 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  48.99 
 
 		 460 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  45.15 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  44.92 
 
 		 465 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.94 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  42.42 
 
 		 456 aa  317  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  50.34 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.49 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  46.21 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  48.46 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.65 
 
 		 433 aa  262  8e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.18 
 
 		 535 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  45.06 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  43.15 
 
 		 410 aa  243  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.48 
 
 		 422 aa  236  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  50.28 
 
 		 438 aa  233  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.39 
 
 		 422 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.57 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  34.56 
 
 		 452 aa  223  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  47.79 
 
 		 424 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  42.37 
 
 		 437 aa  216  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  36.09 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.35 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  37.01 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  36.06 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  37.01 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  37.01 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  35.68 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  36.48 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  38.24 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  35.38 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  35.38 
 
 		 428 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  35.38 
 
 		 428 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  35.73 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  34.87 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  33.71 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  35.11 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  35.13 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  35.57 
 
 		 462 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  37.62 
 
 		 451 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  39.02 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  36.96 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.86 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3243  sun protein  40.98 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  34.51 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  37.76 
 
 		 427 aa  183  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  31.14 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  31.36 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3351  sun protein  37.98 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  41.12 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3894  sun protein  40 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  37.16 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  36.53 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.33 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  38.62 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  32.26 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  30.83 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  35.41 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.33 
 
 		 449 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  32.86 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  32.31 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0591  sun protein  40 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  39.69 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  39.38 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  35.5 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  39.69 
 
 		 429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  38.51 
 
 		 429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  39.69 
 
 		 429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  38.82 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  38.51 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  38.51 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  38.82 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  38.51 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  38.72 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  38.51 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  38.51 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  39.08 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  35.39 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3139  sun protein  35.23 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  34.34 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3562  sun protein  36.46 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>