55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1683 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  482  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  52.7 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  48.5 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  40.26 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  37.66 
 
 
253 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  39.74 
 
 
244 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  38.84 
 
 
245 aa  145  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  32.78 
 
 
245 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  31.91 
 
 
245 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  40.16 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  40.09 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  31.95 
 
 
245 aa  131  9e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  36.51 
 
 
235 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  33.19 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  34.16 
 
 
326 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  35.48 
 
 
328 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  32.77 
 
 
254 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  30.92 
 
 
270 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  30.84 
 
 
234 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  32.53 
 
 
322 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  30.74 
 
 
365 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  29.87 
 
 
232 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  30.92 
 
 
258 aa  95.5  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  30.93 
 
 
237 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  34.33 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  30.17 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  31.95 
 
 
263 aa  89  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  30.65 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  33.73 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  30.74 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  32.64 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  27.76 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  29.63 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  32.48 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  30.13 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  30.62 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  27.76 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  31.09 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  29.5 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  32.57 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  32.11 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  30.36 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  30.63 
 
 
328 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  25.34 
 
 
375 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  28.37 
 
 
388 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  26.96 
 
 
401 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  25.24 
 
 
424 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  27.07 
 
 
401 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  26.75 
 
 
392 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  26.32 
 
 
388 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  25.56 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  26.09 
 
 
401 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  23.85 
 
 
388 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  25.24 
 
 
428 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  26.48 
 
 
437 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>