142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0206 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  31.48 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  34.64 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  31.9 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  31.85 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  31.87 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  31.71 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  31.71 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  31.87 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  31.71 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  31.71 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  26.28 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  31.13 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  31.1 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  31.1 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  31.1 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  31.1 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  31.1 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  31.1 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  30.57 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  26.54 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  27.44 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  26.54 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  26.83 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  26.83 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  26.83 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  26.83 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  26.54 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  26.83 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  26.83 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  26.71 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  29.88 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  25.93 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  26.17 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  24.84 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  35.85 
 
 		 674 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  26.45 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  24.68 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  28.67 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  24.68 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  24.68 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  25.47 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  39.44 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  39.44 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  26.14 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  25.53 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  28.21 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  24.52 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  28.48 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  26.83 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  40.98 
 
 		 662 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 771 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  40 
 
 		 219 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  39.66 
 
 		 332 aa  50.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  42.86 
 
 		 542 aa  50.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  26.57 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  35 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  25.62 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  37.14 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  40.35 
 
 		 666 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  39.29 
 
 		 568 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 		 764 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  42.31 
 
 		 668 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 667 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  39.29 
 
 		 567 aa  47.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  35.09 
 
 		 222 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  34.85 
 
 		 564 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  37.29 
 
 		 232 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  44.9 
 
 		 401 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  26.57 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  38.1 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  35.09 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  23.12 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.07 
 
 		 697 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  39.13 
 
 		 720 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  39.66 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  37.93 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  35.48 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 		 541 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  35.59 
 
 		 672 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  33.82 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  26.71 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  39.66 
 
 		 231 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.29 
 
 		 671 aa  44.7  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  45.24 
 
 		 335 aa  44.7  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  35.09 
 
 		 614 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 213 aa  44.3  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  29.69 
 
 		 233 aa  44.3  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  32.81 
 
 		 229 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  37.1 
 
 		 658 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  32.81 
 
 		 229 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  30.69 
 
 		 350 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  23.6 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  40.82 
 
 		 652 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  31.75 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  22.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>