More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0036 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
316 aa  653    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  87.22 
 
 
319 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.71 
 
 
317 aa  461  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.31 
 
 
317 aa  418  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.26 
 
 
319 aa  389  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  56.11 
 
 
308 aa  348  8e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.21 
 
 
310 aa  347  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.56 
 
 
308 aa  345  7e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.09 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.23 
 
 
315 aa  333  2e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
313 aa  322  4e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.39 
 
 
310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.54 
 
 
312 aa  299  4e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.84 
 
 
313 aa  299  4e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.69 
 
 
309 aa  288  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.3 
 
 
325 aa  278  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.41 
 
 
324 aa  275  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 
311 aa  265  8e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.63 
 
 
321 aa  258  8e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.41 
 
 
312 aa  258  8e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.54 
 
 
311 aa  248  1e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 
314 aa  248  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.61 
 
 
331 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.91 
 
 
308 aa  245  6e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.38 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  42.12 
 
 
317 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.23 
 
 
301 aa  232  6e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
311 aa  229  4e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.23 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 
317 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.5 
 
 
292 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.18 
 
 
292 aa  162  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 
296 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 
302 aa  160  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
292 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
333 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
328 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.47 
 
 
309 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.72 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  32.7 
 
 
308 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 
309 aa  146  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
310 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
310 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
332 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
309 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
309 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.29 
 
 
309 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
304 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
308 aa  142  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
329 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.41 
 
 
309 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
310 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
310 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
328 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.42 
 
 
298 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
306 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.18 
 
 
310 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
314 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
310 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
317 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.74 
 
 
318 aa  135  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  30.23 
 
 
302 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.89 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  29.06 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
303 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
331 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  31.6 
 
 
333 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 
309 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  31.71 
 
 
332 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
312 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
331 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  31.12 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45434  nad-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
364 aa  132  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  31.12 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  31.6 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  31.12 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556189  normal  0.226818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
306 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
308 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>