148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0653 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  55.19 
 
 		 780 aa  853    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  50.81 
 
 		 810 aa  796    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  100 
 
 		 811 aa  1631    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  55.68 
 
 		 780 aa  858    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  54.76 
 
 		 781 aa  832    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  28.89 
 
 		 785 aa  334  3e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  28.38 
 
 		 794 aa  332  2e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  27.79 
 
 		 786 aa  331  3e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  28.5 
 
 		 783 aa  327  6e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  27.59 
 
 		 784 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  29.04 
 
 		 781 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  29.1 
 
 		 941 aa  303  9e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  28.51 
 
 		 932 aa  302  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  28.01 
 
 		 910 aa  293  9e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  27.7 
 
 		 783 aa  290  7e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  28.55 
 
 		 607 aa  194  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  26.97 
 
 		 1087 aa  187  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  27.57 
 
 		 835 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  25.31 
 
 		 1058 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  28.59 
 
 		 1070 aa  182  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  24.72 
 
 		 982 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  28.89 
 
 		 852 aa  179  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  26.65 
 
 		 1485 aa  178  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  24.73 
 
 		 784 aa  177  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 		 912 aa  174  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  25.52 
 
 		 818 aa  173  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  27.92 
 
 		 1044 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  23.71 
 
 		 764 aa  172  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  26.25 
 
 		 882 aa  169  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  25.83 
 
 		 794 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  25.89 
 
 		 796 aa  165  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  25.36 
 
 		 787 aa  165  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  26.94 
 
 		 990 aa  164  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  26.14 
 
 		 1459 aa  160  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  27.34 
 
 		 1353 aa  160  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  25.14 
 
 		 810 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  25.54 
 
 		 808 aa  156  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  26.92 
 
 		 793 aa  156  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  25.54 
 
 		 799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  25.07 
 
 		 877 aa  155  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  27.9 
 
 		 1463 aa  154  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  25.5 
 
 		 810 aa  153  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  23.81 
 
 		 853 aa  153  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  25.21 
 
 		 816 aa  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  25.15 
 
 		 810 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  26.27 
 
 		 807 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  25.19 
 
 		 792 aa  152  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.78 
 
 		 787 aa  151  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  25.3 
 
 		 871 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  24.52 
 
 		 782 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  23.92 
 
 		 929 aa  149  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  26.48 
 
 		 795 aa  148  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  23.04 
 
 		 854 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  24.88 
 
 		 783 aa  147  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  24.68 
 
 		 790 aa  147  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  25.4 
 
 		 797 aa  147  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  25.16 
 
 		 788 aa  146  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  23.62 
 
 		 853 aa  147  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  26.73 
 
 		 788 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  23.88 
 
 		 854 aa  146  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  24.44 
 
 		 783 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  24.84 
 
 		 783 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  23.85 
 
 		 790 aa  145  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  24.68 
 
 		 809 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  24.84 
 
 		 783 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  24.67 
 
 		 789 aa  144  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  24.54 
 
 		 786 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  24.48 
 
 		 818 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  24.44 
 
 		 821 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  24.16 
 
 		 809 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  23.22 
 
 		 786 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  24.66 
 
 		 812 aa  142  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  25.04 
 
 		 821 aa  142  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2007  DNA-directed DNA polymerase B  22.96 
 
 		 788 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0006  cyclic nucleotide-binding protein  24.53 
 
 		 793 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  24.05 
 
 		 783 aa  141  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  24.05 
 
 		 783 aa  141  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  24.16 
 
 		 792 aa  140  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  26.07 
 
 		 789 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  26.07 
 
 		 789 aa  140  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  23.89 
 
 		 783 aa  140  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  23.89 
 
 		 783 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  23.89 
 
 		 783 aa  140  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  23.82 
 
 		 809 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  23.89 
 
 		 783 aa  140  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  24.06 
 
 		 809 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  25.87 
 
 		 789 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  22.94 
 
 		 786 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  24.18 
 
 		 789 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  25 
 
 		 796 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  22.94 
 
 		 786 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  23.89 
 
 		 783 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  23.61 
 
 		 783 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0006  DNA polymerase B region  24.22 
 
 		 811 aa  138  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  23.34 
 
 		 791 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  23.97 
 
 		 783 aa  137  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  24.12 
 
 		 801 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  23.32 
 
 		 786 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  23.79 
 
 		 820 aa  136  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  23.55 
 
 		 796 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>