More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2024 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  100 
 
 		 128 aa  260  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  77.78 
 
 		 126 aa  206  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  74.02 
 
 		 127 aa  193  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  69.84 
 
 		 127 aa  187  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  70.87 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  69.84 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  69.05 
 
 		 126 aa  184  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  68.29 
 
 		 128 aa  182  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  69.84 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  68.25 
 
 		 126 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  68.25 
 
 		 126 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  67.72 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  67.48 
 
 		 128 aa  181  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  67.21 
 
 		 127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  69.84 
 
 		 126 aa  180  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  68.25 
 
 		 126 aa  180  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  68.25 
 
 		 128 aa  180  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  68.25 
 
 		 126 aa  180  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  72 
 
 		 128 aa  180  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  69.84 
 
 		 126 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  67.46 
 
 		 126 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  67.74 
 
 		 127 aa  179  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  68.03 
 
 		 127 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  68.03 
 
 		 127 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  67.5 
 
 		 127 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  67.21 
 
 		 127 aa  177  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  69.84 
 
 		 127 aa  176  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  67.21 
 
 		 127 aa  176  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 127 aa  176  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  65.32 
 
 		 128 aa  173  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  64.75 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  64.75 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  64.75 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  64.75 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  63.71 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  64.75 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  60.16 
 
 		 128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  61.72 
 
 		 128 aa  170  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  65 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  65.12 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 		 127 aa  167  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  65.08 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  59.06 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  59.52 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  56.25 
 
 		 128 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  59.52 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  61.42 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  61.11 
 
 		 126 aa  160  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  59.52 
 
 		 151 aa  159  9e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  71.43 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  56.35 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  56.35 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  58.68 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  56.45 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  55.91 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0410  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000330558  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  52.27 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  52.03 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 124 aa  120  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  46.77 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  52.54 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  49.59 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  51.24 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  49.23 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  47.93 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>