233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1663 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  100 
 
 		 108 aa  219  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  40.19 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  38.32 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  38.78 
 
 		 250 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.14 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  40.59 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  38.32 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.65 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.64 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  36.67 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  36.67 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.89 
 
 		 437 aa  73.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  40.54 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  42.05 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  36.45 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 436 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  39.78 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  26.85 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  36.47 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  39.77 
 
 		 250 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0427  anti-anti-sigma factor  30.1 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0998  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  31.82 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  31.73 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  29.63 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  29.59 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  39.56 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 782 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  32.38 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  28.71 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  27.72 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.68 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.96 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  30.77 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  31.68 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 		 405 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  31 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4611  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.17 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  28.85 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25.74 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  27.1 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>