More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6750 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  630  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  81.76 
 
 		 327 aa  524  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  75.17 
 
 		 324 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  76.16 
 
 		 341 aa  474  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  71.52 
 
 		 334 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  71.15 
 
 		 325 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  71.95 
 
 		 325 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  64.24 
 
 		 319 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  64.33 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  66.01 
 
 		 304 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  65.33 
 
 		 322 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  62.25 
 
 		 301 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  67.22 
 
 		 324 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  62.38 
 
 		 310 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  61.06 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  58.36 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  62.09 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  55.45 
 
 		 337 aa  345  8e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  59.08 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  57.76 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  55.96 
 
 		 295 aa  321  8e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  56.52 
 
 		 300 aa  321  9.000000000000001e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  55.7 
 
 		 299 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  54.18 
 
 		 290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  54.36 
 
 		 290 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  54.36 
 
 		 290 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  53.87 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  54.67 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  54.36 
 
 		 299 aa  298  8e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  54.46 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  49.24 
 
 		 329 aa  292  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  49.83 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  54.7 
 
 		 290 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  53.87 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  53.87 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  50.16 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  50.65 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  49 
 
 		 358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  51.79 
 
 		 287 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  57.24 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  51.16 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.33 
 
 		 367 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  51.5 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  48.76 
 
 		 384 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  52.16 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  45.37 
 
 		 384 aa  278  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  48.6 
 
 		 421 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  48.6 
 
 		 377 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  50.16 
 
 		 351 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  50.67 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  47.8 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  48.11 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  44.74 
 
 		 351 aa  266  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.48 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  47.35 
 
 		 375 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.66 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  46.38 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  43.83 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  44.7 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.82 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  41.25 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  41.88 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  42.72 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  42.28 
 
 		 309 aa  208  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  41.39 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  40.32 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  40.45 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  40.19 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  40.65 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  40 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.31 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  39.68 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  39.01 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  40.5 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  42.46 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  34.3 
 
 		 751 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  33.64 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  31.27 
 
 		 433 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  31.74 
 
 		 369 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  31.92 
 
 		 586 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  31.25 
 
 		 510 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32.79 
 
 		 742 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.07 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  29.88 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.77 
 
 		 517 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  35.53 
 
 		 390 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.49 
 
 		 826 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.31 
 
 		 554 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.48 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.65 
 
 		 517 aa  102  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  32.89 
 
 		 259 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  33.11 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.72 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.35 
 
 		 829 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  31.85 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  37.88 
 
 		 605 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 621 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  30.42 
 
 		 481 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  30.1 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>