More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6020 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  87.1 
 
 		 290 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  54.91 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  64.13 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.519057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  54.91 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  57.3 
 
 		 322 aa  301  9e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 321 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0183  LysR family transcriptional regulator  56.88 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  53.6 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  42.39 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.44 
 
 		 296 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 299 aa  201  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  45.19 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  41.52 
 
 		 304 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 284 aa  195  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 306 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 		 285 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2839  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 294 aa  185  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  41.6 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1770  transcriptional regulator, LysR family  44.4 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  41.2 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  43.03 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  42.63 
 
 		 313 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  38.76 
 
 		 280 aa  175  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1278  LysR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0095  LysR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 293 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6632  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994606 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  37.32 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  41.18 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  37.26 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4271  LysR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 323 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5787  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6152  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5807  LysR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  34.65 
 
 		 298 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6037  LysR family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.4 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3916  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0255667  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 298 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0961  LysR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2647  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  41.13 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 287 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2586  transcriptional regulator LysR family  37.18 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0425  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7706  LysR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0368  LysR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5162  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  38.8 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0683  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2824  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4219  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  37.85 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  35.71 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>