68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0061 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  100 
 
 		 349 aa  705    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  35.69 
 
 		 342 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  34.37 
 
 		 357 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  36 
 
 		 182 aa  92.8  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  34.39 
 
 		 191 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  38.18 
 
 		 174 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  32.63 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.41 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  35.1 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  39.18 
 
 		 193 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  31.58 
 
 		 196 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  30.87 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  33.59 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  31.82 
 
 		 168 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  25.56 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  25.27 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  26.26 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  23.6 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  23.88 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  24.5 
 
 		 197 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  30 
 
 		 556 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  24.32 
 
 		 168 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  29.14 
 
 		 576 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  25.18 
 
 		 184 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  24.21 
 
 		 185 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  30.67 
 
 		 534 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  29.73 
 
 		 531 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  29.73 
 
 		 566 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  29.73 
 
 		 531 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  29.1 
 
 		 137 aa  52.8  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  23.72 
 
 		 174 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0285  hypothetical protein  30.23 
 
 		 177 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  33.04 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  27.92 
 
 		 196 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  30.06 
 
 		 531 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  34.29 
 
 		 610 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.98 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  23.19 
 
 		 179 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  28.36 
 
 		 145 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  29.1 
 
 		 618 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  32.61 
 
 		 471 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.33 
 
 		 602 aa  46.2  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.53 
 
 		 471 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  28.7 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  26.21 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.53 
 
 		 471 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0234  hypothetical protein  30.19 
 
 		 165 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.889032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1096  Thioredoxin-related protein  22.29 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.32 
 
 		 592 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.63 
 
 		 810 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0428  hypothetical protein  17.8 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  29.33 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.73 
 
 		 613 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.57 
 
 		 610 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  26.95 
 
 		 522 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.73 
 
 		 613 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.73 
 
 		 613 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  26.95 
 
 		 522 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1809  hypothetical protein  19.85 
 
 		 155 aa  43.5  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.73 
 
 		 628 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  26.95 
 
 		 522 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  28.57 
 
 		 631 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  26.95 
 
 		 522 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  26.95 
 
 		 522 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  26.95 
 
 		 522 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  26.95 
 
 		 522 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  24.46 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>