286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0989 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0989  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
337 aa  688  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00574869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  35.15 
 
 
328 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.76448e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.85 
 
 
348 aa  198  1e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.85 
 
 
349 aa  198  1e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  34.22 
 
 
336 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  34.22 
 
 
336 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  36.42 
 
 
343 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  36.92 
 
 
353 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  36.13 
 
 
310 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.13 
 
 
310 aa  182  9e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  36.13 
 
 
310 aa  182  9e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  36.13 
 
 
310 aa  182  9e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  36.13 
 
 
310 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  36.14 
 
 
310 aa  179  5e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  37.27 
 
 
339 aa  179  5e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  33.94 
 
 
323 aa  179  6e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  37.79 
 
 
310 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  36.48 
 
 
317 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  35.83 
 
 
310 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  35.83 
 
 
310 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.12 
 
 
310 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.12 
 
 
310 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.12 
 
 
310 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.12 
 
 
310 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.12 
 
 
310 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  35.99 
 
 
307 aa  176  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  35.23 
 
 
310 aa  174  2e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  34.53 
 
 
329 aa  174  2e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  34.43 
 
 
309 aa  173  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  34.2 
 
 
329 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  33.65 
 
 
389 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  35.79 
 
 
309 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  34.2 
 
 
329 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  33.88 
 
 
329 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  33.88 
 
 
329 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  32.38 
 
 
314 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  33.88 
 
 
329 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  33.88 
 
 
329 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  33.88 
 
 
320 aa  167  3e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  33.88 
 
 
320 aa  167  3e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  33.44 
 
 
365 aa  166  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  33.65 
 
 
316 aa  166  6e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  1.70574e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  35.45 
 
 
307 aa  166  7e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  33.65 
 
 
316 aa  165  1e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  3.09284e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  34.85 
 
 
329 aa  165  1e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  33.65 
 
 
316 aa  164  2e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  33.55 
 
 
330 aa  164  2e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  33.87 
 
 
310 aa  163  4e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  35.43 
 
 
349 aa  162  8e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  33.43 
 
 
334 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  33.02 
 
 
325 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  31.72 
 
 
325 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  32.63 
 
 
355 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  32.63 
 
 
355 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  32.63 
 
 
355 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  35.91 
 
 
339 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  33.11 
 
 
310 aa  159  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  34 
 
 
339 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33 
 
 
334 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  32.63 
 
 
356 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  33.66 
 
 
318 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  32.06 
 
 
314 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  32.63 
 
 
356 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  34.2 
 
 
329 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  34.48 
 
 
309 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 
323 aa  155  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  32.91 
 
 
355 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  32.91 
 
 
325 aa  154  3e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  30.91 
 
 
319 aa  153  3e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  31.93 
 
 
355 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  35.1 
 
 
335 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  34 
 
 
350 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  33.86 
 
 
335 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  4.04715e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  32.59 
 
 
324 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  33.23 
 
 
324 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  32.52 
 
 
332 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  34.1 
 
 
310 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  34.72 
 
 
310 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  32.59 
 
 
359 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1502  allophanate hydrolase subunit 2  33.33 
 
 
339 aa  149  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  34.71 
 
 
345 aa  149  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  32.37 
 
 
339 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4360  allophanate hydrolase subunit 2  32.9 
 
 
312 aa  148  1e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  32.48 
 
 
325 aa  149  1e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  34.45 
 
 
339 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  34.43 
 
 
318 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  32.12 
 
 
359 aa  146  4e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  31.11 
 
 
335 aa  147  4e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  32.12 
 
 
359 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  32.12 
 
 
371 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  32.12 
 
 
359 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  35.57 
 
 
344 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  32.12 
 
 
371 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  32.12 
 
 
371 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1708  urea amidolyase related protein  34.03 
 
 
339 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0203426  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  32.12 
 
 
371 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  31.89 
 
 
323 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  31.97 
 
 
350 aa  145  7e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  30.99 
 
 
323 aa  145  8e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  32.91 
 
 
336 aa  145  8e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>