More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0486 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  100 
 
 		 508 aa  977    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  55.54 
 
 		 549 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  59.72 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  59.15 
 
 		 508 aa  467  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  54.51 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  49.61 
 
 		 536 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  55.32 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  50.38 
 
 		 525 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  46.41 
 
 		 549 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  46.31 
 
 		 547 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  43.39 
 
 		 496 aa  316  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  43.63 
 
 		 558 aa  304  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  43.11 
 
 		 494 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  41.55 
 
 		 486 aa  296  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  42.35 
 
 		 498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  41.41 
 
 		 480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  40.56 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  41.95 
 
 		 498 aa  282  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  40.67 
 
 		 490 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  41.22 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  41.72 
 
 		 507 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  41.72 
 
 		 507 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  41.78 
 
 		 505 aa  264  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  41.72 
 
 		 507 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  41.04 
 
 		 502 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  39.64 
 
 		 494 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  45.78 
 
 		 498 aa  256  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  39.68 
 
 		 514 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  39.32 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  40.13 
 
 		 494 aa  216  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  38.89 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  43.61 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.11 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  38.58 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.59 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  39.84 
 
 		 288 aa  67  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  39.69 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  36.81 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  31.94 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  28.95 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  29.27 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  30.37 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  37.5 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  40.22 
 
 		 271 aa  62  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  25 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  28.29 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  27.95 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  35 
 
 		 236 aa  60.1  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  30.06 
 
 		 326 aa  59.7  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2160  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.78 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.971286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32.89 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  32.54 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1673  HemK family modification methylase  34.23 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0452249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  34.16 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  38.16 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  34.42 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  31.36 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  36.07 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  37.66 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.5 
 
 		 280 aa  57  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  40.21 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  40.79 
 
 		 288 aa  57  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  40.79 
 
 		 285 aa  57  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  36 
 
 		 372 aa  57  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3080  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.31 
 
 		 305 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.27 
 
 		 394 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.71 
 
 		 304 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  41.33 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  34.33 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 		 286 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.4 
 
 		 343 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  29.63 
 
 		 202 aa  55.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1415  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.84 
 
 		 314 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.270918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1480  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.84 
 
 		 314 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.760634  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1468  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.84 
 
 		 314 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.11 
 
 		 285 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  31.97 
 
 		 296 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  32.61 
 
 		 317 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 330 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  36.36 
 
 		 210 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  33.72 
 
 		 324 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  29.19 
 
 		 278 aa  54.7  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  27.98 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  35.25 
 
 		 231 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0650  hypothetical protein  27.21 
 
 		 268 aa  54.3  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.348415  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  40 
 
 		 278 aa  54.3  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  33.51 
 
 		 231 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  40.79 
 
 		 284 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  33.54 
 
 		 341 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  37.67 
 
 		 388 aa  53.5  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2753  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.11 
 
 		 314 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0853524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.13 
 
 		 354 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.48 
 
 		 317 aa  53.5  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.76 
 
 		 322 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  34.75 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2847  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.11 
 
 		 314 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000091809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2770  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.11 
 
 		 314 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526087  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  31.65 
 
 		 201 aa  53.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>