More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1598 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
297 aa  597  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  50.67 
 
 
305 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  41.22 
 
 
304 aa  235  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  49.65 
 
 
308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  39.22 
 
 
307 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  37.5 
 
 
305 aa  162  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  37.88 
 
 
310 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  36.27 
 
 
301 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  39.13 
 
 
311 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  39.26 
 
 
308 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  38.08 
 
 
298 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  38.13 
 
 
311 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  34.23 
 
 
303 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  37.29 
 
 
310 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  37.7 
 
 
299 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  34.52 
 
 
302 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  39.54 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  38.39 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  33.55 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  34 
 
 
301 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  37.66 
 
 
313 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  36.45 
 
 
310 aa  142  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  34.67 
 
 
300 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  34.33 
 
 
300 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  37.25 
 
 
302 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  34.67 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  34.67 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  34.78 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  32.99 
 
 
303 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  33.44 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  31.7 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  33.44 
 
 
315 aa  112  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  29.22 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  30.98 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  32.7 
 
 
319 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  31.6 
 
 
312 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  31.43 
 
 
310 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  31.17 
 
 
311 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  32.99 
 
 
307 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  29.14 
 
 
346 aa  97.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  30.69 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  31.25 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  29.22 
 
 
320 aa  89  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  29.63 
 
 
800 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  28.12 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  30.51 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  26.42 
 
 
804 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.25 
 
 
615 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.51 
 
 
609 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.03 
 
 
605 aa  83.2  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  29.77 
 
 
839 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  26.44 
 
 
774 aa  83.2  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  28.85 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30 
 
 
605 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  26.17 
 
 
807 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  29.7 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1861  homocysteine S-methyltransferase  26.62 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  28.94 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  27.24 
 
 
791 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  25.89 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4784  homocysteine S-methyltransferase  29.9 
 
 
643 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  27.63 
 
 
1249 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.96 
 
 
610 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.49 
 
 
605 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  24.68 
 
 
413 aa  72.8  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.15 
 
 
610 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  30.64 
 
 
818 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.97 
 
 
617 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2437  methionine synthase (B12-dependent)  28.93 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0709  methionine synthase I  28.32 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  27.37 
 
 
629 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0799  methionine synthase I  28.72 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2124  methionine synthase I  28.72 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0843  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.35 
 
 
611 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  23.59 
 
 
780 aa  69.3  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  27.44 
 
 
1263 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  29.53 
 
 
820 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3207  methionine synthase (B12-dependent)  28.27 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  25.32 
 
 
768 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  26.46 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.52 
 
 
604 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.537957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  27.88 
 
 
1251 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  25.76 
 
 
1225 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  28.37 
 
 
841 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  28.14 
 
 
1264 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  25 
 
 
768 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  28.14 
 
 
1264 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0626  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.21 
 
 
599 aa  65.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.490063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  25.9 
 
 
819 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  29.13 
 
 
1257 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  28.01 
 
 
1251 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3426  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.82 
 
 
617 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  29.02 
 
 
1220 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  26.44 
 
 
1228 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3407  homocysteine S-methyltransferase  25.89 
 
 
358 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174744  normal  0.0184405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2547  methionine synthase I  28.12 
 
 
340 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.946299 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  24.52 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  27.43 
 
 
806 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  25.9 
 
 
1227 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.42 
 
 
615 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>