More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0867 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.76 
 
 
762 aa  679    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.45 
 
 
760 aa  863    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  42.6 
 
 
777 aa  650    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
783 aa  1577    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  70.18 
 
 
755 aa  1050    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  43.95 
 
 
778 aa  645    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  43.91 
 
 
778 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  43.32 
 
 
772 aa  628  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  43.16 
 
 
790 aa  620  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.48 
 
 
771 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.93 
 
 
795 aa  594  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.83 
 
 
782 aa  580  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  38.84 
 
 
805 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.93 
 
 
773 aa  528  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.97 
 
 
756 aa  525  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.11 
 
 
807 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.04 
 
 
806 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  38.16 
 
 
788 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.63 
 
 
798 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  38.73 
 
 
811 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.25 
 
 
792 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.97 
 
 
791 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.26 
 
 
778 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.17 
 
 
771 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.6 
 
 
769 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.64 
 
 
784 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.95 
 
 
807 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  39.51 
 
 
817 aa  478  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.59 
 
 
785 aa  477  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  38.78 
 
 
802 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.16 
 
 
790 aa  475  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.62 
 
 
760 aa  469  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  38.57 
 
 
789 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  36.34 
 
 
808 aa  459  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.46 
 
 
757 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.4 
 
 
809 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.04 
 
 
760 aa  452  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  39.46 
 
 
737 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.02 
 
 
813 aa  442  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.77 
 
 
811 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.27 
 
 
803 aa  439  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.74 
 
 
768 aa  435  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.47 
 
 
754 aa  435  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  37.3 
 
 
859 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.77 
 
 
760 aa  432  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.67 
 
 
762 aa  431  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.62 
 
 
902 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  34.65 
 
 
743 aa  422  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  33.8 
 
 
740 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  33.38 
 
 
743 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  35.6 
 
 
772 aa  411  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  36.1 
 
 
750 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  36.08 
 
 
721 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  36.02 
 
 
1037 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.42 
 
 
702 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  36.12 
 
 
738 aa  406  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.8 
 
 
799 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.45 
 
 
733 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  34.93 
 
 
739 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.42 
 
 
752 aa  401  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.22 
 
 
736 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.71 
 
 
751 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.54 
 
 
801 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  33.94 
 
 
766 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  35.54 
 
 
727 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  35.54 
 
 
727 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  35.47 
 
 
764 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  35.18 
 
 
774 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  35.04 
 
 
765 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  33.59 
 
 
765 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.69 
 
 
766 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  33.25 
 
 
753 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.43 
 
 
804 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.86 
 
 
751 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  33.55 
 
 
772 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  35.42 
 
 
793 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  33.29 
 
 
765 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.29 
 
 
765 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  33.96 
 
 
787 aa  373  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  33.92 
 
 
763 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  32.08 
 
 
745 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.28 
 
 
768 aa  376  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  33.46 
 
 
755 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.19 
 
 
769 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  33.16 
 
 
765 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  33.21 
 
 
755 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.16 
 
 
765 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  34.68 
 
 
764 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  33.16 
 
 
765 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.08 
 
 
768 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  33.16 
 
 
765 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  34.75 
 
 
764 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  33.46 
 
 
765 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  33.16 
 
 
765 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  33.16 
 
 
765 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  33.33 
 
 
755 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.05 
 
 
765 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  33.33 
 
 
755 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.25 
 
 
769 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  33.55 
 
 
763 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>