168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0955 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  100 
 
 		 173 aa  346  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  83.82 
 
 		 173 aa  295  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  43.71 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  40.91 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  38.96 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.59 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.18 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.67 
 
 		 161 aa  131  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  48 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  43.79 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  42.48 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  42.48 
 
 		 158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.33 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  41.18 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.72 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  42 
 
 		 162 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  42.67 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.45 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.45 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.37 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  41.61 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  46.15 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  44.3 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  41.29 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  43.87 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.03 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.62 
 
 		 154 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  41.61 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.67 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.26 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.85 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.73 
 
 		 151 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.91 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.19 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  41.43 
 
 		 145 aa  108  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.34 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  36.67 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.58 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  37.75 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.58 
 
 		 220 aa  99.8  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  31.65 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.48 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  35.48 
 
 		 159 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.16 
 
 		 245 aa  91.3  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.84 
 
 		 253 aa  90.5  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.37 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.16 
 
 		 245 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.37 
 
 		 242 aa  89  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34 
 
 		 194 aa  87.8  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.84 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  35 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  38.02 
 
 		 197 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1407  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.64 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.29 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.59 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  34.62 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  33.58 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.73 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  33.08 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  33.1 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  40.58 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02190  hypothetical protein  33.1 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.727435  normal  0.427786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00414  CheD  37.04 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.999613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0669  CheD, stimulates methylation of MCP protein  35.1 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0620166  normal  0.293268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.41 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.33 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  33.76 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.57 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  31.13 
 
 		 199 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.37 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  28.92 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.37 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.33 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.85 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  28.15 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.11 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2630  chemotaxis protein  32.39 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0335  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.97 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1144  chemotaxis protein CheD, putative  31.3 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000787559  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  32.12 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2439  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.07 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0431  hypothetical protein  30.46 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.13773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.82 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.31 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0570  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.37 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0963  CheD, stimulates methylation of MCP protein  32.14 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  28.77 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1103  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.26 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1382  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.8 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2899  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30.37 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5563900000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  30.37 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2116  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.37 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  34.31 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.58 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.01 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.370177 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>