More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5240 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  51.94 
 
 
911 aa  775  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.41961e-05  hitchhiker  3.3715e-09 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  62.31 
 
 
899 aa  886  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 
931 aa  774  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  54.99 
 
 
970 aa  744  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  62.15 
 
 
886 aa  667  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.96185e-05  hitchhiker  1.70911e-09 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  54.32 
 
 
912 aa  778  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  56.79 
 
 
934 aa  805  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  55.58 
 
 
936 aa  784  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  56.9 
 
 
901 aa  786  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.05239e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  57.4 
 
 
936 aa  783  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  54.65 
 
 
956 aa  744  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  54.65 
 
 
914 aa  772  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  55.51 
 
 
931 aa  784  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  53.91 
 
 
921 aa  766  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  54.92 
 
 
914 aa  777  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  55.15 
 
 
958 aa  749  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0287  preprotein translocase subunit SecA  54.47 
 
 
964 aa  739  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.196625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0511  preprotein translocase subunit SecA  53.51 
 
 
946 aa  754  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  56.68 
 
 
910 aa  780  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  57.52 
 
 
909 aa  785  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  53.58 
 
 
905 aa  739  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1220  preprotein translocase subunit SecA  57.93 
 
 
916 aa  749  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  56.76 
 
 
901 aa  783  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  55.74 
 
 
907 aa  782  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  55.4 
 
 
914 aa  769  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  56.34 
 
 
901 aa  775  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  56.34 
 
 
901 aa  775  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  61.58 
 
 
958 aa  902  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  62.66 
 
 
962 aa  860  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 
902 aa  771  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0990  preprotein translocase subunit SecA  50.13 
 
 
944 aa  710  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  56.34 
 
 
901 aa  776  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  56.34 
 
 
901 aa  775  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  56.34 
 
 
901 aa  775  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  57.76 
 
 
932 aa  784  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  55.27 
 
 
907 aa  768  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  4.05863e-05  unclonable  6.59986e-08 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  52.87 
 
 
963 aa  736  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  57.29 
 
 
1018 aa  774  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  52.24 
 
 
907 aa  770  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.17033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  57.04 
 
 
910 aa  779  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  54.57 
 
 
907 aa  761  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  8.08939e-05  hitchhiker  2.70752e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  56.9 
 
 
901 aa  786  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.73806e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  56.76 
 
 
901 aa  784  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.13856e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  57.89 
 
 
909 aa  795  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  53.6 
 
 
1024 aa  741  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  54.33 
 
 
916 aa  783  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0512  preprotein translocase, SecA subunit  53.03 
 
 
931 aa  750  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171651  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  54.95 
 
 
935 aa  768  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  55.19 
 
 
919 aa  782  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  54 
 
 
904 aa  763  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  63.22 
 
 
944 aa  875  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1021  preprotein translocase subunit SecA  55.71 
 
 
906 aa  759  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  68.02 
 
 
859 aa  692  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3567  preprotein translocase subunit SecA  54.16 
 
 
908 aa  732  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  53.59 
 
 
971 aa  746  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  53.81 
 
 
911 aa  756  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  56.9 
 
 
901 aa  786  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.42397e-05  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  56.9 
 
 
901 aa  786  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  54 
 
 
904 aa  763  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  58.56 
 
 
903 aa  818  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0922  preprotein translocase subunit SecA  54.02 
 
 
921 aa  720  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.666696  normal  0.803255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  54.21 
 
 
911 aa  764  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  58.54 
 
 
897 aa  830  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  2.53416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  54.99 
 
 
970 aa  747  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  54 
 
 
904 aa  763  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  54.33 
 
 
913 aa  783  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  57.34 
 
 
932 aa  780  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  55.01 
 
 
915 aa  786  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  51.94 
 
 
908 aa  776  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  8.62629e-06 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  49.22 
 
 
1032 aa  704  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  51.94 
 
 
908 aa  776  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.66764e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  54.62 
 
 
949 aa  763  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3269  preprotein translocase subunit SecA  48.39 
 
 
930 aa  698  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659799  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  55.51 
 
 
954 aa  793  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  57.18 
 
 
909 aa  785  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3628  preprotein translocase, SecA subunit  55.12 
 
 
950 aa  734  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0804577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 
1067 aa  2195  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  54.13 
 
 
920 aa  758  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  56.6 
 
 
916 aa  772  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  60.23 
 
 
888 aa  833  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1366  preprotein translocase, SecA subunit  57.18 
 
 
997 aa  745  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779073  normal  0.444827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  62.83 
 
 
836 aa  662  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  58.3 
 
 
872 aa  825  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.11083e-06  unclonable  3.74715e-10 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  52.31 
 
 
934 aa  741  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1814e-06 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  54.52 
 
 
916 aa  748  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1822  preprotein translocase, SecA subunit  55.04 
 
 
906 aa  741  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  64.79 
 
 
838 aa  671  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20600  protein translocase subunit secA  53.88 
 
 
985 aa  735  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.648191  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  53.68 
 
 
867 aa  766  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  53.11 
 
 
890 aa  748  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09420  protein translocase subunit secA  55.48 
 
 
931 aa  741  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.915131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3738  preprotein translocase, SecA subunit  55.6 
 
 
947 aa  747  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361446  normal  0.764216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  53.61 
 
 
933 aa  751  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1081  preprotein translocase, SecA subunit  55.49 
 
 
917 aa  747  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2325  preprotein translocase, SecA subunit  57.49 
 
 
933 aa  763  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0666996  hitchhiker  1.17576e-05 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  51.46 
 
 
980 aa  736  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  53.97 
 
 
1200 aa  736  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1857  preprotein translocase SecA subunit  54.81 
 
 
955 aa  755  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137741  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  53.77 
 
 
928 aa  727  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4277  preprotein translocase, SecA subunit  53.95 
 
 
1075 aa  718  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>