More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1220 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  44.76 
 
 
944 aa  760    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17671  preprotein translocase subunit SecA  78.38 
 
 
945 aa  1523    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  48.57 
 
 
957 aa  840    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18491  preprotein translocase subunit SecA  75.16 
 
 
943 aa  1444    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  49 
 
 
958 aa  847    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  44.96 
 
 
962 aa  761    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20951  preprotein translocase subunit SecA  80.19 
 
 
944 aa  1560    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.396844  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36933  predicted protein  56.66 
 
 
932 aa  1072    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00575996  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1220  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
942 aa  1936    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0984174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0032  preprotein translocase subunit SecA  66.88 
 
 
935 aa  1284    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1643  preprotein translocase, SecA subunit  42.2 
 
 
998 aa  696    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18281  preprotein translocase subunit SecA  74.79 
 
 
943 aa  1466    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2124  preprotein translocase subunit SecA  68.09 
 
 
930 aa  1325    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3658  preprotein translocase subunit SecA  65.86 
 
 
932 aa  1283    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0123  preprotein translocase subunit SecA  77.23 
 
 
937 aa  1514    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0081  preprotein translocase subunit SecA  78.49 
 
 
934 aa  1539    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1732  preprotein translocase subunit SecA  74.87 
 
 
943 aa  1464    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0289  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 
948 aa  1321    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  43.82 
 
 
962 aa  737    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1106  preprotein translocase subunit SecA  67.1 
 
 
935 aa  1280    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18301  preprotein translocase subunit SecA  75.72 
 
 
943 aa  1444    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01511  preprotein translocase subunit SecA  77.61 
 
 
951 aa  1505    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  46.03 
 
 
980 aa  741    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2105  cyclic nucleotide-binding protein  43.26 
 
 
1007 aa  719    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.877046 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9327  nuclear-encoded-like protein of plastid sec  44.11 
 
 
935 aa  732    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3269  preprotein translocase subunit SecA  68.23 
 
 
930 aa  1319    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659799  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  43.07 
 
 
970 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4635  preprotein translocase subunit SecA  69 
 
 
936 aa  1328    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226506  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  44.24 
 
 
962 aa  743    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  49.02 
 
 
1067 aa  730    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  47.63 
 
 
888 aa  803    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1077  preprotein translocase subunit SecA  67.1 
 
 
935 aa  1281    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  46.5 
 
 
945 aa  766    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  58.54 
 
 
894 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  57.97 
 
 
899 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  57.41 
 
 
897 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  58.43 
 
 
896 aa  607  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  56.26 
 
 
993 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  55.27 
 
 
899 aa  596  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  56.95 
 
 
896 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  55.74 
 
 
912 aa  595  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  58.29 
 
 
1009 aa  593  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  55.01 
 
 
992 aa  591  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  57.34 
 
 
886 aa  590  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  56.84 
 
 
873 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  57.12 
 
 
954 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  56.84 
 
 
872 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  56.9 
 
 
896 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  55.74 
 
 
910 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  56 
 
 
917 aa  581  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  56.55 
 
 
994 aa  582  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  56.61 
 
 
903 aa  582  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  54.53 
 
 
1018 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  54.35 
 
 
904 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  56.3 
 
 
834 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  56.79 
 
 
912 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  55.83 
 
 
932 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  56.02 
 
 
845 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  55.64 
 
 
932 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6305  preprotein translocase subunit SecA  53.75 
 
 
975 aa  575  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507355  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  55.64 
 
 
931 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  55.83 
 
 
936 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  54.41 
 
 
866 aa  572  1.0000000000000001e-162  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  55.64 
 
 
931 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  55.02 
 
 
968 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  55.45 
 
 
932 aa  572  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  55.45 
 
 
932 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  54.21 
 
 
897 aa  571  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  55.08 
 
 
910 aa  571  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  55.68 
 
 
909 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  55.45 
 
 
932 aa  572  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  55.64 
 
 
936 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30890  preprotein translocase subunit SecA  54.85 
 
 
955 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164673  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  56.56 
 
 
796 aa  570  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  54.7 
 
 
931 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  54.7 
 
 
931 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  54.34 
 
 
934 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  54.7 
 
 
931 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  54.7 
 
 
931 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  54.07 
 
 
936 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  55.08 
 
 
930 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  54.7 
 
 
931 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  53.5 
 
 
836 aa  566  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  54.7 
 
 
931 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0973  preprotein translocase, SecA subunit  56.4 
 
 
971 aa  568  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16094  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  56.01 
 
 
971 aa  567  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  54.29 
 
 
833 aa  568  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1249  preprotein translocase, SecA subunit  56.18 
 
 
904 aa  566  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  54.7 
 
 
931 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  55.89 
 
 
916 aa  564  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  55.89 
 
 
913 aa  564  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  54.49 
 
 
896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  54.3 
 
 
896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7585  preprotein translocase subunit SecA  55.81 
 
 
928 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.614027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  54.48 
 
 
908 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  54.75 
 
 
915 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 
934 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  55.84 
 
 
824 aa  564  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1366  preprotein translocase, SecA subunit  56.13 
 
 
997 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779073  normal  0.444827 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  55.92 
 
 
859 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>