More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3911 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  59.76 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  56.91 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  56.91 
 
 		 247 aa  285  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  55.37 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  54.88 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  54.07 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  57.44 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  57.44 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  54.47 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  54.07 
 
 		 247 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  52.48 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  52.26 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  52.26 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  49 
 
 		 249 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  51.84 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  52.44 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  49.19 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  51.43 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  51.24 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  52.44 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  52.44 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  52.44 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  51.43 
 
 		 250 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  51.81 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  52.05 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  47.79 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  49.8 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  50.83 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  52.05 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  49.79 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  52.03 
 
 		 248 aa  256  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  49.38 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  52.87 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  52.87 
 
 		 248 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  52.87 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  51.64 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  49.59 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  48.99 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  48.59 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  52.46 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  48.4 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  47.6 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  47.39 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  49.38 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  49.18 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  51.42 
 
 		 248 aa  248  7e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  47.6 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  51.21 
 
 		 252 aa  248  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  47.2 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  48.58 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  52.54 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  49.8 
 
 		 245 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  48.15 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  50.82 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  50.81 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  46.77 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  52.08 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  52.08 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  48.4 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  51.64 
 
 		 250 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  48.79 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  47.76 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  49.6 
 
 		 253 aa  244  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  48.73 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  51.05 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  51.85 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  50.41 
 
 		 248 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  46.31 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  48.37 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  50.62 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  48.39 
 
 		 251 aa  242  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  48.99 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  51.02 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  47.58 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  48.19 
 
 		 249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  46.72 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  50.41 
 
 		 247 aa  241  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  47.97 
 
 		 249 aa  241  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  49.18 
 
 		 252 aa  241  7e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  49.18 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  49.18 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  49.18 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  49.18 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  50.82 
 
 		 247 aa  241  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  46.99 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  47.33 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  49.59 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  46.75 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  50.82 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  49.18 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  49.18 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  49.59 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>