More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2253 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 373 aa  760    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  60.98 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  54.44 
 
 		 376 aa  359  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  37.67 
 
 		 358 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  37.67 
 
 		 358 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  37.67 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  39.4 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  37.73 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  38.13 
 
 		 365 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  37.67 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  38.13 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  37.11 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  37.14 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  38.07 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  38.07 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  38.13 
 
 		 350 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  38.07 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  38.07 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  38.07 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  36.77 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  36.77 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  37.97 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  35.28 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  36.81 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  33.24 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  33.51 
 
 		 366 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  58.59 
 
 		 225 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  31.27 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  51.59 
 
 		 224 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  51.59 
 
 		 224 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  51.59 
 
 		 224 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  51.59 
 
 		 224 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  51.59 
 
 		 224 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  51.59 
 
 		 209 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  51.97 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  50 
 
 		 224 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  51.59 
 
 		 179 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  51.97 
 
 		 217 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  33.85 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  49.22 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  49.22 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 222 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 222 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  50 
 
 		 222 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 222 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  50 
 
 		 222 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  32.1 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  50.4 
 
 		 215 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  48.44 
 
 		 218 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  48.44 
 
 		 218 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  52.38 
 
 		 232 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  48.51 
 
 		 218 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  46.88 
 
 		 218 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  28.24 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  46.88 
 
 		 217 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  48.8 
 
 		 215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  48 
 
 		 215 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  35.48 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  24.81 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  25.97 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  25.19 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  44.19 
 
 		 219 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  47.5 
 
 		 276 aa  99.8  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  44.19 
 
 		 218 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  44.19 
 
 		 218 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.43 
 
 		 242 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2907  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.22 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  43.05 
 
 		 276 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6867  OmpA/MotB domain protein  44.22 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301365  normal  0.329522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  25.65 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  29.7 
 
 		 326 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 		 210 aa  96.3  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  25.45 
 
 		 404 aa  96.3  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  42.64 
 
 		 219 aa  96.3  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0237  OmpA/MotB domain protein  42.75 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  42.64 
 
 		 212 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  41.72 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3148  OmpA/MotB domain-containing protein  46.4 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.6 
 
 		 214 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  29.38 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6884  OmpA/MotB domain protein  37.2 
 
 		 362 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177157  normal  0.158984 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  40.38 
 
 		 276 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  40.38 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  40.38 
 
 		 276 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  40.38 
 
 		 276 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  40.38 
 
 		 276 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  40.38 
 
 		 276 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  30.12 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  40.38 
 
 		 252 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  25.51 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  39.52 
 
 		 187 aa  90.1  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.13 
 
 		 607 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  25.85 
 
 		 372 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  38.58 
 
 		 223 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  39.2 
 
 		 236 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40.48 
 
 		 219 aa  89.7  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  39.2 
 
 		 236 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  39.2 
 
 		 236 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  33.51 
 
 		 190 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  38.58 
 
 		 236 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>