More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0122 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  50.87 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  42.93 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  48.45 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  50 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.994247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  42.78 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0077  ABC transporter related  42.49 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0734436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  43.18 
 
 		 199 aa  140  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  40.57 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  46.63 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  44.44 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  47.4 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2409  ABC transporter related  42.24 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  44.51 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.41 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.9 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.9 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.9 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.9 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.05 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.05 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  35.05 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.05 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  35.05 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.05 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.05 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7996  ABC transporter related  45.12 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0883006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.57 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.07 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 		 220 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.36 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  36.26 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  27.69 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  32.65 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  27.69 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  33.51 
 
 		 259 aa  96.3  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  33.68 
 
 		 274 aa  95.5  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  33.66 
 
 		 213 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.51 
 
 		 227 aa  95.5  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3265  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  32.34 
 
 		 385 aa  95.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  34.18 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  37.3 
 
 		 350 aa  94.4  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  37.25 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  29.69 
 
 		 375 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3378  ABC transporter related  33.5 
 
 		 561 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  32.67 
 
 		 235 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  30.52 
 
 		 264 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  35.29 
 
 		 353 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1750  ABC transporter related  30.51 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.465278  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  30.65 
 
 		 249 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  32.18 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  31.96 
 
 		 249 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  31.96 
 
 		 249 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  31.96 
 
 		 249 aa  92  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.05 
 
 		 240 aa  91.7  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0375  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 		 316 aa  91.7  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 		 253 aa  91.7  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  32.02 
 
 		 243 aa  91.3  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  33.71 
 
 		 253 aa  91.3  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3473  ABC transporter related  30.77 
 
 		 532 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17580  ABC transporter related  32.32 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000826667  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.7 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  31.12 
 
 		 385 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  27.49 
 
 		 378 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  29.05 
 
 		 254 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2632  ABC transporter-related protein  32.81 
 
 		 357 aa  90.5  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.014615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  30.32 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  30.53 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  29.65 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  30.22 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 216 aa  89.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  30.22 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  30.22 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  31.58 
 
 		 314 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  29.44 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 256 aa  89.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  30.65 
 
 		 246 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  33.15 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3346  ABC transporter related  30.77 
 
 		 532 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  29.44 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1480  ATPase  33.81 
 
 		 235 aa  89.4  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  33.7 
 
 		 228 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  29.44 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  35 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.51 
 
 		 351 aa  89.4  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  35 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3672  ABC transporter related  30.99 
 
 		 533 aa  89.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  33.5 
 
 		 348 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  31.46 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  30.2 
 
 		 563 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.08 
 
 		 374 aa  89  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  32.78 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>