More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1863 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
558 aa  1097  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  55.72 
 
 
595 aa  565  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  54.26 
 
 
566 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  54.46 
 
 
562 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  53.59 
 
 
551 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  54.84 
 
 
561 aa  548  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  57.27 
 
 
575 aa  544  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  54.44 
 
 
541 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  56.06 
 
 
572 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  54.04 
 
 
572 aa  521  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  53.75 
 
 
546 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  55.01 
 
 
561 aa  510  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  48.98 
 
 
548 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  51.02 
 
 
547 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  50.84 
 
 
547 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  48.81 
 
 
720 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  62.14 
 
 
424 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  52.9 
 
 
566 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  39.28 
 
 
566 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  38.87 
 
 
566 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  1.10445e-08 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  38.97 
 
 
565 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  38.14 
 
 
566 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.5 
 
 
575 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
571 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 
577 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  31.01 
 
 
576 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 
578 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  28.91 
 
 
574 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 
592 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
567 aa  204  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 
674 aa  203  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 
567 aa  202  1e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.09 
 
 
567 aa  200  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 
565 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 
598 aa  196  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  28.65 
 
 
682 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.99 
 
 
671 aa  193  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.04 
 
 
720 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 
574 aa  191  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 
584 aa  187  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 
649 aa  186  1e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  24.95 
 
 
648 aa  185  2e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 
583 aa  185  2e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  24.95 
 
 
648 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 
673 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  24.95 
 
 
648 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  25.05 
 
 
648 aa  183  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  24.68 
 
 
648 aa  183  9e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  27.26 
 
 
650 aa  183  9e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  27.15 
 
 
575 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 
636 aa  182  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  25.05 
 
 
648 aa  181  3e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  25.05 
 
 
648 aa  181  3e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  26 
 
 
650 aa  181  5e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 
664 aa  180  6e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  28.52 
 
 
581 aa  180  6e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 
562 aa  180  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 
656 aa  180  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  24.95 
 
 
648 aa  180  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 
741 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  30.06 
 
 
564 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  27.92 
 
 
556 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  26.76 
 
 
662 aa  177  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.26 
 
 
648 aa  177  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  27.34 
 
 
564 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  26.21 
 
 
649 aa  176  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 
775 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
665 aa  176  1e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  26.39 
 
 
653 aa  176  1e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  30.72 
 
 
666 aa  175  2e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  27.29 
 
 
606 aa  175  2e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  29.58 
 
 
660 aa  174  3e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  31.42 
 
 
666 aa  174  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 
565 aa  173  6e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  25.9 
 
 
561 aa  173  7e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  26.29 
 
 
561 aa  173  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  26.19 
 
 
563 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  4.02209e-08 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  27.37 
 
 
576 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 
657 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  25.33 
 
 
649 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 
762 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 
606 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.85 
 
 
697 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.35 
 
 
663 aa  169  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  29.39 
 
 
584 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  29.45 
 
 
660 aa  168  3e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 
567 aa  168  3e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  27.19 
 
 
624 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 
667 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 
671 aa  167  6e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  26.31 
 
 
563 aa  166  1e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4140  sodium/hydrogen exchanger  30.55 
 
 
571 aa  166  1e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435228  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 
665 aa  166  1e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3291  sodium/hydrogen exchanger  30.55 
 
 
571 aa  166  1e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.99669  normal  0.66857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  28.57 
 
 
555 aa  166  1e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4226  sodium/hydrogen exchanger  30.55 
 
 
571 aa  166  1e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.646549  normal  0.336088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4122  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 
571 aa  165  2e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75928  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  28.6 
 
 
582 aa  165  2e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3648  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 
571 aa  165  2e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279447  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1285  potassium efflux system family protein  29.89 
 
 
619 aa  165  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>