More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4248 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
412 aa  802    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  48.23 
 
 
445 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  40.59 
 
 
385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  40.31 
 
 
375 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  40.21 
 
 
375 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  39.52 
 
 
387 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  39.25 
 
 
387 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  39.25 
 
 
387 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  39.25 
 
 
387 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  39.25 
 
 
387 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  39.25 
 
 
387 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  39.63 
 
 
375 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  39.25 
 
 
387 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  39.63 
 
 
375 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  39.63 
 
 
375 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  39.63 
 
 
375 aa  256  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  39.63 
 
 
375 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  39.25 
 
 
387 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  39.37 
 
 
375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  38.71 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  38.17 
 
 
387 aa  253  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  38.48 
 
 
396 aa  249  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  39.63 
 
 
375 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  39.63 
 
 
375 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  39.63 
 
 
375 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  40.26 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  40.16 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  38.94 
 
 
400 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.95 
 
 
399 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  38.81 
 
 
399 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  34.15 
 
 
389 aa  206  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  33.33 
 
 
375 aa  199  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.54 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  35.05 
 
 
379 aa  195  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  38.42 
 
 
413 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.25 
 
 
418 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  32.56 
 
 
423 aa  192  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  37.28 
 
 
413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  34.35 
 
 
469 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  36.5 
 
 
415 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 
392 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  31.92 
 
 
392 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 
491 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 
399 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 
392 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 
473 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 
416 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 
404 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 
385 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.19 
 
 
352 aa  176  9e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  32.95 
 
 
474 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  29.18 
 
 
414 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 
412 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.52 
 
 
427 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  33.25 
 
 
424 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 
388 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 
424 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  30.91 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  29.49 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 
398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  30.55 
 
 
388 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  34.96 
 
 
485 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0547  Kef-type K+ transport systems, membrane component  29.97 
 
 
318 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  29.25 
 
 
748 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  33.26 
 
 
462 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 
513 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  29.52 
 
 
389 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
404 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 
386 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 
586 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  31.77 
 
 
587 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 
586 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.1 
 
 
587 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 
586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 
586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.81 
 
 
741 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  30.85 
 
 
585 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  34.59 
 
 
460 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  30.85 
 
 
585 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.7 
 
 
587 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 
398 aa  144  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 
745 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 
756 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 
749 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
586 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 
585 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.42 
 
 
585 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 
585 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 
436 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 
402 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 
741 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>