More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1033 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  100 
 
 
427 aa  885    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  50.62 
 
 
439 aa  359  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  64.79 
 
 
418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  60.85 
 
 
411 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  50.66 
 
 
420 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  52.14 
 
 
428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  64.15 
 
 
422 aa  333  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  44.89 
 
 
420 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  52.19 
 
 
429 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  62.07 
 
 
421 aa  328  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  46.21 
 
 
422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  57 
 
 
429 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
422 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  43.89 
 
 
420 aa  324  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  45.86 
 
 
437 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  46.92 
 
 
418 aa  322  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  51.44 
 
 
429 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  60.94 
 
 
415 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  48.19 
 
 
428 aa  316  6e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  43.83 
 
 
433 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  44.99 
 
 
431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  54.15 
 
 
418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  61.32 
 
 
369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  45.85 
 
 
422 aa  306  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  42.51 
 
 
418 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.3 
 
 
417 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  58.49 
 
 
439 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  47.79 
 
 
435 aa  300  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  41.94 
 
 
428 aa  300  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  50.52 
 
 
419 aa  298  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  54.71 
 
 
419 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  47.89 
 
 
427 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  56.92 
 
 
395 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  56.06 
 
 
427 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 
411 aa  286  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 
433 aa  285  8e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  52.61 
 
 
420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  53.48 
 
 
431 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  37.91 
 
 
424 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  51.91 
 
 
427 aa  277  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  49.83 
 
 
422 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  54.15 
 
 
411 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  51.38 
 
 
423 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  43.77 
 
 
407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  49.21 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  37.57 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.57 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  46.35 
 
 
468 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  46.08 
 
 
474 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  36.59 
 
 
429 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  45.73 
 
 
474 aa  250  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  36.13 
 
 
424 aa  250  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  50.2 
 
 
256 aa  249  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  38.02 
 
 
409 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  49.01 
 
 
456 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  37.98 
 
 
408 aa  246  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  47.64 
 
 
443 aa  245  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  45.63 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  45.83 
 
 
424 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  47.72 
 
 
411 aa  243  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  43.62 
 
 
435 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  47.58 
 
 
264 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  54.23 
 
 
247 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  35.48 
 
 
870 aa  239  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  54.59 
 
 
245 aa  237  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  47.06 
 
 
488 aa  237  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  44.57 
 
 
457 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  47.43 
 
 
472 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  45.74 
 
 
816 aa  237  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  48.15 
 
 
241 aa  236  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  45.53 
 
 
464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  48.35 
 
 
241 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  47.11 
 
 
266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.63 
 
 
454 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  45.49 
 
 
493 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  34.76 
 
 
425 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  48.94 
 
 
254 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
465 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
469 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
465 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
465 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
471 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
465 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
465 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
469 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
250 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 
416 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  48.23 
 
 
449 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  39.6 
 
 
472 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  45.9 
 
 
438 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  45.04 
 
 
420 aa  230  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  51.49 
 
 
649 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  43.43 
 
 
394 aa  229  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  46.7 
 
 
400 aa  229  9e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  47.74 
 
 
478 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  47.22 
 
 
447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  50 
 
 
410 aa  226  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  34.28 
 
 
435 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  34.42 
 
 
433 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>