More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0990 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  44.84 
 
 
949 aa  723  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0511  preprotein translocase subunit SecA  42.81 
 
 
946 aa  699  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0287  preprotein translocase subunit SecA  46.97 
 
 
964 aa  740  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.196625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  48.18 
 
 
899 aa  814  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  63.21 
 
 
931 aa  1130  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  44.24 
 
 
970 aa  702  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  45.96 
 
 
886 aa  800  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.96185e-05  hitchhiker  1.70911e-09 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  46.11 
 
 
912 aa  761  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  46.18 
 
 
934 aa  766  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  46.96 
 
 
936 aa  757  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 
901 aa  760  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.05239e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  45.03 
 
 
866 aa  760  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  46.44 
 
 
936 aa  756  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  45.17 
 
 
956 aa  725  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  47.73 
 
 
914 aa  776  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  46.47 
 
 
931 aa  759  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  46.2 
 
 
921 aa  766  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  46.46 
 
 
910 aa  772  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  46.83 
 
 
901 aa  757  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  46.83 
 
 
901 aa  757  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  45.42 
 
 
911 aa  741  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.41961e-05  hitchhiker  3.3715e-09 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  45.38 
 
 
909 aa  753  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  48.81 
 
 
787 aa  797  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  45.54 
 
 
835 aa  753  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  44.83 
 
 
905 aa  716  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1220  preprotein translocase subunit SecA  45.24 
 
 
916 aa  721  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 
901 aa  760  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  46.04 
 
 
907 aa  746  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  46.89 
 
 
914 aa  793  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  46.83 
 
 
901 aa  757  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  46.83 
 
 
901 aa  757  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  45.25 
 
 
958 aa  786  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  46.31 
 
 
962 aa  801  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  45.76 
 
 
902 aa  746  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0990  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
944 aa  1906  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  46.94 
 
 
901 aa  758  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  46.13 
 
 
919 aa  760  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  47.52 
 
 
914 aa  777  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  43.55 
 
 
958 aa  716  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  44.3 
 
 
1032 aa  723  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  44.83 
 
 
971 aa  763  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3567  preprotein translocase subunit SecA  46.05 
 
 
908 aa  724  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  47.95 
 
 
859 aa  801  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  46.81 
 
 
1018 aa  781  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  45.81 
 
 
907 aa  751  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.17033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  45.76 
 
 
910 aa  743  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  45.87 
 
 
907 aa  737  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  8.08939e-05  hitchhiker  2.70752e-06 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  47.03 
 
 
868 aa  768  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 
901 aa  760  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.73806e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 
901 aa  759  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.13856e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  47.36 
 
 
909 aa  754  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  49.29 
 
 
1024 aa  820  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  45.64 
 
 
916 aa  768  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0512  preprotein translocase, SecA subunit  43.76 
 
 
931 aa  730  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171651  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  46.77 
 
 
935 aa  747  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  45.42 
 
 
908 aa  741  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  8.62629e-06 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  43.74 
 
 
858 aa  703  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  9.54938e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  46.46 
 
 
915 aa  758  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  46.8 
 
 
932 aa  762  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  44.7 
 
 
907 aa  723  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  4.05863e-05  unclonable  6.59986e-08 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  45.29 
 
 
963 aa  718  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  44.77 
 
 
911 aa  748  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 
901 aa  760  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.42397e-05  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1241  preprotein translocase subunit SecA  50.58 
 
 
871 aa  814  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00118655  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 
901 aa  760  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  47.23 
 
 
903 aa  810  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0922  preprotein translocase subunit SecA  44.78 
 
 
921 aa  717  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.666696  normal  0.803255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  45.16 
 
 
911 aa  749  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  48.69 
 
 
897 aa  834  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  2.53416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  44.87 
 
 
835 aa  738  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  44.72 
 
 
970 aa  712  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  45.54 
 
 
913 aa  766  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  46.47 
 
 
932 aa  762  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  47.22 
 
 
824 aa  749  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1313  preprotein translocase subunit SecA  49.03 
 
 
864 aa  778  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3738  preprotein translocase, SecA subunit  46 
 
 
947 aa  755  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361446  normal  0.764216 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  47.59 
 
 
909 aa  756  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3628  preprotein translocase, SecA subunit  45.44 
 
 
950 aa  733  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0804577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  50.13 
 
 
1067 aa  711  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  46.05 
 
 
920 aa  744  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  45.91 
 
 
916 aa  752  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  45.92 
 
 
837 aa  740  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  49.89 
 
 
888 aa  833  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1366  preprotein translocase, SecA subunit  48.19 
 
 
997 aa  767  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779073  normal  0.444827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  45.07 
 
 
836 aa  733  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  49.18 
 
 
872 aa  801  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.11083e-06  unclonable  3.74715e-10 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  46.02 
 
 
796 aa  758  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  44.89 
 
 
934 aa  736  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1814e-06 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  47.42 
 
 
916 aa  773  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1822  preprotein translocase, SecA subunit  46.76 
 
 
906 aa  762  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  45.02 
 
 
838 aa  759  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20600  protein translocase subunit secA  44.04 
 
 
985 aa  717  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.648191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  48.72 
 
 
954 aa  819  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  47.53 
 
 
859 aa  753  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  46.89 
 
 
867 aa  744  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  48.14 
 
 
933 aa  797  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1081  preprotein translocase, SecA subunit  45.25 
 
 
917 aa  738  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2325  preprotein translocase, SecA subunit  46.64 
 
 
933 aa  781  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0666996  hitchhiker  1.17576e-05 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  44.43 
 
 
980 aa  744  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1857  preprotein translocase SecA subunit  46.18 
 
 
955 aa  761  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>