More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0189 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0189  transcriptional regulatory protein, C-terminal domain protein  100 
 
 		 296 aa  607  9.999999999999999e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1194  putative response regulator  64.05 
 
 		 266 aa  325  6e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3090  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  53.36 
 
 		 241 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04930  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.6 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.793732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3035  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  55.42 
 
 		 243 aa  260  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0439  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  50.58 
 
 		 248 aa  258  8e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.190602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3419  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  51.41 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0595  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0453  putative winged helix family two component transcriptional regulator  48.3 
 
 		 251 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.275136 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2025  response regulator receiver protein  49.42 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0895  response regulator receiver protein  49.8 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0879  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  49.79 
 
 		 259 aa  234  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249855  hitchhiker  0.00478466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6823  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6372  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  48.93 
 
 		 236 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0443  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6176  winged helix family two component response transcriptional regulator  49.57 
 
 		 247 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4525  response regulator receiver protein  48.24 
 
 		 257 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4612  response regulator receiver protein  48.24 
 
 		 257 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4908  response regulator receiver protein  48.24 
 
 		 257 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4240  transcriptional regulator domain-containing protein  46.59 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466466  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0337  winged helix family two component response transcriptional regulator  44.66 
 
 		 239 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5097  response regulator receiver protein  49.78 
 
 		 267 aa  229  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2737  transcriptional regulatory protein  46.13 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0293  winged helix family two component response transcriptional regulator  46.28 
 
 		 239 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4983  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  44.66 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4376  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  48.77 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1650  response regulator receiver protein  50.68 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0110992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8253  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4646  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2724  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  46.77 
 
 		 232 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00387379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3545  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37670  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  51.07 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0528352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3012  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.721979  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3935  transcriptional regulator domain protein  47.39 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10833  transcriptional regulatory protein  47.27 
 
 		 255 aa  208  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12898  transcriptional regulator  39.57 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.385025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0241  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  59.14 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6843  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  33.76 
 
 		 258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03550  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.76 
 
 		 261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.329191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1126  transcriptional regulator  54.08 
 
 		 223 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000289398  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08240  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.38 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal  0.778898 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_944  transcriptional regulator  54.08 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2015  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  34.18 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0839248  hitchhiker  0.0000000000000188648 
 
 
-
 
NC_002936  DET1162  transcriptional regulator, putative  35.21 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.829609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0955  two component transcriptional regulator  51.02 
 
 		 223 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.16 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19870  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47 
 
 		 224 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.931606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 231 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  35.9 
 
 		 227 aa  99  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 242 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 229 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 229 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 229 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.69 
 
 		 229 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  35.38 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.7 
 
 		 226 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0416  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 228 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 227 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0432  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 224 aa  97.4  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000490664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 235 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.33 
 
 		 229 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  48.08 
 
 		 232 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  32.74 
 
 		 229 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  32.74 
 
 		 229 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.7 
 
 		 226 aa  96.3  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 229 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  34.24 
 
 		 230 aa  96.3  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  52.22 
 
 		 227 aa  96.3  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  47.47 
 
 		 229 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  95.5  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  32.07 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  32.07 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 230 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 223 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  32.07 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  32.07 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3253  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  35.93 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  32.07 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  32.61 
 
 		 223 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  31.52 
 
 		 223 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 225 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  29.74 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>