96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0047 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 135 aa  280  6.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  66.67 
 
 		 119 aa  94.4  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  50 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  48.53 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  34.23 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  34.23 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  42.11 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  43.08 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  38.03 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  43.33 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  43.55 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  44.07 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  34.67 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  39.06 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  40.85 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  34.29 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  49.18 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  48.08 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  32.73 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  31.07 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  39.44 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  49.12 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  42.19 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  37.31 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  48.94 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  43.4 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  53.33 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  41.33 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  35.64 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  27.54 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  31.17 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32.84 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  38.81 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  34.85 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 240 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  31.88 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  52.63 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  30.26 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  38.81 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  35.06 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  43.33 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  43.33 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  32.88 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  43.33 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  31.82 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  31.82 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  75 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  31.71 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  40 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  35.09 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  42.62 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  36.99 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  34.38 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  48.33 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  38.57 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  35.82 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  37.1 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  30.14 
 
 		 118 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  34.25 
 
 		 117 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1539  ribonuclease P protein component  55.36 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000058475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  39.44 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  36.84 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  46.34 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  29.23 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  36.62 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  36.62 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  42.59 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  33.75 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  33.71 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  38.33 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  30.85 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  33.33 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  38.33 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>