More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1632 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0914  ATP-dependent RNA helicase RhlE  78.3 
 
 		 447 aa  695    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  78.35 
 
 		 451 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  79.63 
 
 		 439 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0754  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.11 
 
 		 447 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0016093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 447 aa  907    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  76.24 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  76.5 
 
 		 453 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.756474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0570  DNA/RNA helicase  70.14 
 
 		 432 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1278000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.3 
 
 		 425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3701  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.58 
 
 		 467 aa  536  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000590991  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.45 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000132586  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_002936  DET0183  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  59.89 
 
 		 560 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.475928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_172  hypothetical protein  60.7 
 
 		 561 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000114775  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0169  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.5 
 
 		 561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000471101  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1998  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.61 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1190  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.88 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107478 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.53 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000744604 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2480  DEAD/DEAH box helicase-like  56.78 
 
 		 530 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.045241  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  47.75 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.19 
 
 		 526 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.19 
 
 		 515 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.19 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.19 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  53.44 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  52.5 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.97 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.54 
 
 		 578 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.48 
 
 		 565 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.14 
 
 		 550 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.6 
 
 		 549 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.37 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  48.64 
 
 		 540 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  48.7 
 
 		 510 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  48.53 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.87 
 
 		 549 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.22 
 
 		 560 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.98 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.47 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.52 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  51.98 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.37 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.98 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  46.9 
 
 		 543 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.65 
 
 		 540 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  51.98 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.61 
 
 		 477 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.62 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.98 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.72 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.27 
 
 		 535 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.72 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.32 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  51.72 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.26 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.19 
 
 		 515 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.48 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.72 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.72 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  49.23 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.24 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  45.11 
 
 		 495 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.49 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.06 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.31 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.41 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  48.4 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.69 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.69 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  50.66 
 
 		 579 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.66 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  52.88 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  46.29 
 
 		 557 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.31 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.35 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1011  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.47 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.87 
 
 		 545 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.13 
 
 		 571 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.93 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.68 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.27 
 
 		 492 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.22 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.58 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2810  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.93 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2898  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.93 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.53 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.12 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2088  putative ATP-dependent RNA helicase 1  48.13 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.936977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  48.63 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  48.46 
 
 		 574 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.46 
 
 		 418 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.46 
 
 		 418 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  49.34 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.34 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.34 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  48.95 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1362  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.48 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.34 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  49.34 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>